More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0504 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 438 aa  883    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  72.54 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  69.57 
 
 		 428 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  68.19 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  73.02 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  67.28 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  67.28 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  66.97 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  56.12 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  56.12 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  54.34 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  54.57 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  55.73 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  52.78 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  53.24 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  52.78 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  53.36 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  51.85 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  46.84 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  45.18 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  42.01 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.41 
 
 		 464 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  40.42 
 
 		 434 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.82 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.82 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  39.46 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  299  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.91 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.44 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 		 443 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  40.31 
 
 		 453 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.05 
 
 		 461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 420 aa  279  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  35.5 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  38.73 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  36.95 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  41.01 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.95 
 
 		 429 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  38.44 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.81 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.4 
 
 		 422 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  39.4 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.8 
 
 		 420 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 432 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  37.7 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  39.68 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  36.8 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.16 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 435 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  37.86 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  38.01 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 428 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 439 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  39.17 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>