More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0492 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  52.73 
 
 
338 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  48.16 
 
 
352 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.07 
 
 
356 aa  292  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2123  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.13 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2079  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.14 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1864  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  45.65 
 
 
368 aa  281  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.47842  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  53.07 
 
 
311 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1501  riboflavin kinase / FAD synthetase  46.8 
 
 
320 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.324751  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.78 
 
 
308 aa  235  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19371  putative riboflavin kinase/FAD synthase  45.08 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0839  putative riboflavin kinase/FAD synthase  42.91 
 
 
317 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.123466  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16921  putative riboflavin kinase/FAD synthase  42.57 
 
 
317 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0897  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  46.51 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.72 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13171  putative riboflavin kinase/FAD synthase  40.88 
 
 
305 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.263547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.33 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.45 
 
 
308 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0612  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.14 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.115533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.76 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.15 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.56 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  44.22 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  44.22 
 
 
312 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.08 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0996  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.32 
 
 
295 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.58 
 
 
330 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.74 
 
 
309 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14721  putative riboflavin kinase/FAD synthase  37.93 
 
 
307 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2071  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  41.51 
 
 
310 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.275327  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.09 
 
 
306 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.84 
 
 
316 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.42 
 
 
309 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.18 
 
 
317 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  41.77 
 
 
306 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1367  putative riboflavin kinase/FAD synthase  36.73 
 
 
307 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.413233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.22 
 
 
311 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.2 
 
 
311 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.2 
 
 
311 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.84 
 
 
322 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.84 
 
 
316 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.51 
 
 
313 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14341  putative riboflavin kinase/FAD synthase  37.24 
 
 
307 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  43.16 
 
 
306 aa  205  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  42.81 
 
 
310 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.26 
 
 
311 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0180  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.33 
 
 
329 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.01321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  34.98 
 
 
307 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.52 
 
 
312 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.23 
 
 
325 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14581  putative riboflavin kinase/FAD synthase  37.46 
 
 
307 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.16 
 
 
322 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
311 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
311 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.44 
 
 
314 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.87 
 
 
311 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3030  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.08 
 
 
329 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.87 
 
 
311 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.66 
 
 
294 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
311 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.97 
 
 
321 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.03 
 
 
311 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.93 
 
 
315 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.53 
 
 
311 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.03 
 
 
316 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.22 
 
 
310 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.96 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1739  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.33 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.614187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.54 
 
 
311 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.94 
 
 
314 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2653  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.9 
 
 
335 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.92 
 
 
355 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1327  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.04 
 
 
326 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.586967  normal  0.980544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  40 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.87 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.37 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.73 
 
 
311 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  38.7 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  38.23 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.22 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0861  riboflavin biosynthesis protein RibF  40 
 
 
322 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.204041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.92 
 
 
311 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.71 
 
 
306 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.47 
 
 
311 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.71 
 
 
310 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  38.26 
 
 
307 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3158  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.4 
 
 
331 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0387095  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.68 
 
 
307 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0808  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.4 
 
 
331 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.62 
 
 
311 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.94 
 
 
309 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.95 
 
 
324 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.58 
 
 
308 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.75 
 
 
312 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40 
 
 
328 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2725  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.02 
 
 
332 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  39.04 
 
 
320 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2336  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.02 
 
 
332 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.532241  normal  0.131688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.89 
 
 
322 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>