More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0485 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
445 aa  902    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  58.13 
 
 
447 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  59.78 
 
 
449 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  56.35 
 
 
448 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  57.27 
 
 
447 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  56.57 
 
 
448 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  55.58 
 
 
452 aa  511  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  55.92 
 
 
459 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  47.44 
 
 
442 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  47.44 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  48.44 
 
 
443 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  50.66 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  44.77 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  44.99 
 
 
442 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  51.02 
 
 
547 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  49.78 
 
 
442 aa  392  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  44.32 
 
 
442 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.88 
 
 
442 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  46.28 
 
 
214 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
214 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
214 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 
214 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 
214 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
208 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
213 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
213 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
214 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.78 
 
 
205 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
211 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
204 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.49 
 
 
213 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.33 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
200 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.66 
 
 
200 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.66 
 
 
200 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
209 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 
196 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  36.36 
 
 
197 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
212 aa  113  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 
253 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.07 
 
 
222 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35517  predicted protein  36.76 
 
 
220 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0923281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
222 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
200 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
207 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
209 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
206 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
198 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 
209 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
240 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
370 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
201 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
201 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 
227 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
188 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
205 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
200 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
200 aa  99.8  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 
224 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 
208 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
207 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 
207 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 
237 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  32.8 
 
 
201 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  32.08 
 
 
215 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
204 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
201 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
215 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
215 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
215 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
215 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
215 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  32.35 
 
 
203 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.35 
 
 
203 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.35 
 
 
205 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.35 
 
 
203 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.94 
 
 
203 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.35 
 
 
203 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
223 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 
218 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
215 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
207 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
221 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.16 
 
 
203 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.79 
 
 
210 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
217 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
223 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
241 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>