28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0407 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 
80 aa  154  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  63.29 
 
 
91 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  60.49 
 
 
93 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  62.03 
 
 
91 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  64.1 
 
 
90 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  67.14 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  56.58 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  50 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  52.63 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  53.85 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  53.85 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  45.33 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  42.31 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  47.5 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  40 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  44 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  37.66 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.06 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.44 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.44 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  51.32 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  32.91 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  32.91 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  37.18 
 
 
87 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.18 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  30.77 
 
 
86 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  32.91 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.9 
 
 
84 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>