More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0402 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  100 
 
 
174 aa  343  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  56.46 
 
 
176 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  52.86 
 
 
180 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  48.78 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  51.91 
 
 
183 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2275  protein of unknown function UPF0054  54.25 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2326  protein of unknown function UPF0054  54.25 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.475999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  51.2 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  58.49 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  45.39 
 
 
187 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  49.58 
 
 
156 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  48.6 
 
 
189 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  44.09 
 
 
153 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  46.49 
 
 
154 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  44.64 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  44.14 
 
 
156 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  46.02 
 
 
157 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  46.36 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  44.64 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  46.36 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  45.54 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  41.86 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  41.67 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  39.85 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  46.9 
 
 
301 aa  89.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  37.7 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.88 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  40.35 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  35.21 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  34.13 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  47.2 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  39.58 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 
446 aa  87.4  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  43.22 
 
 
184 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  37.59 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.31 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  33.56 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  46.39 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.41 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  39.37 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  41.32 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  39.37 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.1 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  36.07 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  36.65 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  39.67 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  34.48 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  43.16 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  39.67 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  38.84 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  42.27 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  50.55 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.31 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  37.6 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  34.07 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.59 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  41.75 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  37.98 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  40.2 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  36.44 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  33.33 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  34.46 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  44.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  30.72 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  42.11 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.21 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  37.5 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  36.76 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  36.76 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.9 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  33.12 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  43.43 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  37.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>