299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0355 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  83.9 
 
 		 132 aa  197  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  78.15 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  77.12 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  74.79 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  68.03 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  69.3 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  69.3 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  58.33 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  57.02 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  55.37 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  47.54 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  44.26 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  47.32 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  33.59 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  32.56 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  32.81 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  35.81 
 
 		 171 aa  89.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  37.23 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  32.82 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  38.58 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  36.5 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  35 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  35.65 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  35.92 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 171 aa  76.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  34.59 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  34.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  38.76 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  32.09 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>