More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0354 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  100 
 
 
542 aa  1084    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.87 
 
 
552 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.87 
 
 
534 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.87 
 
 
534 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.95 
 
 
537 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  45.76 
 
 
538 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  44.84 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.37 
 
 
543 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  44.26 
 
 
549 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  39.01 
 
 
544 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  38.53 
 
 
544 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  46.18 
 
 
966 aa  260  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.03 
 
 
698 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  41.38 
 
 
585 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 
624 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 
582 aa  252  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  39.88 
 
 
971 aa  243  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  41.64 
 
 
656 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  38.89 
 
 
992 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 
573 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.05 
 
 
568 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  38.53 
 
 
604 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.31 
 
 
543 aa  240  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 
591 aa  240  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.92 
 
 
543 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 
583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 
444 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.56 
 
 
528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 
976 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  37.17 
 
 
589 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  39.4 
 
 
990 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  38.04 
 
 
520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  40.37 
 
 
1007 aa  226  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  41.37 
 
 
631 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  40.52 
 
 
592 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
426 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  36.66 
 
 
997 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.06 
 
 
580 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.98 
 
 
953 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.5 
 
 
1018 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 
633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.25 
 
 
558 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.3 
 
 
365 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.21 
 
 
600 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.3 
 
 
365 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 
596 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  39 
 
 
427 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.29 
 
 
1002 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 
365 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.99 
 
 
511 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  30.69 
 
 
478 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  42.7 
 
 
511 aa  208  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.8 
 
 
845 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  40.3 
 
 
552 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  35.69 
 
 
1003 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.95 
 
 
387 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  41.29 
 
 
520 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.78 
 
 
618 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  46.96 
 
 
498 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  36.71 
 
 
1012 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  42.37 
 
 
499 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.11 
 
 
598 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.03 
 
 
420 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.05 
 
 
517 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  44.44 
 
 
365 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  29.59 
 
 
637 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 
393 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.52 
 
 
395 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  36.69 
 
 
699 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  36.69 
 
 
699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  39.58 
 
 
375 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  36.39 
 
 
699 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.32 
 
 
504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  37.54 
 
 
374 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  37.09 
 
 
699 aa  180  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  37.35 
 
 
688 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39 
 
 
503 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.87 
 
 
492 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.68 
 
 
594 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.64 
 
 
379 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.84 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  32.1 
 
 
541 aa  173  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.08 
 
 
375 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  41.03 
 
 
378 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 
382 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.01 
 
 
375 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  34.26 
 
 
734 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.67 
 
 
484 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  44.4 
 
 
468 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.84 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  39.21 
 
 
673 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.91 
 
 
348 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  39.93 
 
 
575 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.94 
 
 
373 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  35.92 
 
 
382 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.17 
 
 
392 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  37.82 
 
 
537 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  32.3 
 
 
586 aa  159  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.15 
 
 
359 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  35.33 
 
 
557 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>