More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0338 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
105 aa  214  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  61.39 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  58.42 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  56.44 
 
 
105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  56.31 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  55.34 
 
 
113 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  55.45 
 
 
105 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  55.45 
 
 
105 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  54.9 
 
 
111 aa  120  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  53.33 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  56.52 
 
 
122 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  50.49 
 
 
122 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  49.02 
 
 
122 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  49.02 
 
 
122 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  50.5 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  47.62 
 
 
108 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
122 aa  107  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  46.67 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  46.67 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
122 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  49.49 
 
 
99 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  44.66 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  46.46 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  45.45 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  45.45 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  45.45 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  45.45 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  46.46 
 
 
99 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  45.92 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  46.46 
 
 
99 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  44.44 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
99 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
99 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  46.74 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  44.79 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  44.44 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  48.24 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  47.37 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  47.47 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  50 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  41.75 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  40.78 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  41.05 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  44.68 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  44.68 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  44.79 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  40.57 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  40.78 
 
 
122 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
102 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  39.18 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  39.39 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  44.58 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  45.57 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  38.38 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  39.8 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  39.8 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  42.17 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.45 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  34.86 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  42.11 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  34.86 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  39.02 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  39.02 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.74 
 
 
348 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.46 
 
 
358 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  41.77 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.77 
 
 
382 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  39.77 
 
 
382 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.77 
 
 
382 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  40.23 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.33 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.33 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  40.51 
 
 
366 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  38.82 
 
 
381 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  39.08 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.82 
 
 
380 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  35.35 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 
380 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 
381 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40 
 
 
414 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 
380 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  39.02 
 
 
379 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.98 
 
 
368 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.65 
 
 
380 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  32 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  38.64 
 
 
382 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  40.96 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.24 
 
 
385 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>