88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0334 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  49.71 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  49.7 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  49.7 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  47.43 
 
 		 180 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.58 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  45.09 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  41.3 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  39.18 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  39.49 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.38 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  35.15 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.5 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.06 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  24.66 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  22.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.95 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.08 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  30.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.45 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  25.31 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.75 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  27.89 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  27.89 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30.12 
 
 		 238 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  37.35 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.83 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  29.88 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  24.36 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.88 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  29.07 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.49 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.04 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.28 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 		 156 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 		 188 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 		 179 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 		 182 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.09 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  31.52 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  25.15 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  28.39 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  32.77 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>