273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0299 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  47.74 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  45.9 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  45.9 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  48.56 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  50.22 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  46.95 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  44.44 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  38.67 
 
 		 273 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  43.72 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 265 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  37.92 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  37.79 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  37.33 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  36.45 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  34.56 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  34.1 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.12 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  37.24 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  39.19 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  34.3 
 
 		 292 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  37.65 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  36.59 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.53 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  35.26 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  35.26 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.72 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  38.14 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  36.05 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  38.03 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.94 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  34.23 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  38.58 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  35.11 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  38.58 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  34.71 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.54 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  31.69 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  34.64 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 338 aa  72  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.81 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.81 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.18 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  35.33 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.97 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>