More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0289 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  69.59 
 
 		 943 aa  1344    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  75.56 
 
 		 932 aa  1472    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 		 958 aa  852    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  69.89 
 
 		 944 aa  1321    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  49.51 
 
 		 1067 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  71.16 
 
 		 945 aa  1358    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  43.66 
 
 		 935 aa  736    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 942 aa  1304    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 		 957 aa  848    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 953 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  77.05 
 
 		 930 aa  1496    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  73.95 
 
 		 935 aa  1418    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  72.98 
 
 		 937 aa  1388    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  73.54 
 
 		 934 aa  1389    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  70.32 
 
 		 943 aa  1345    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 948 aa  1940    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  70.11 
 
 		 943 aa  1330    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  44.42 
 
 		 980 aa  729    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  42.84 
 
 		 951 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  46.06 
 
 		 869 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  57.77 
 
 		 932 aa  1083    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  75.29 
 
 		 930 aa  1467    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  70.11 
 
 		 943 aa  1318    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  73.89 
 
 		 936 aa  1445    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  73.85 
 
 		 935 aa  1415    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  72.84 
 
 		 951 aa  1350    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2105  cyclic nucleotide-binding protein  44.17 
 
 		 1007 aa  755    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.877046 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  42.7 
 
 		 918 aa  697    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  73.12 
 
 		 935 aa  1422    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  59.06 
 
 		 894 aa  632  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  53.18 
 
 		 912 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  59.36 
 
 		 896 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  58.98 
 
 		 873 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  57.38 
 
 		 899 aa  619  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  58.03 
 
 		 896 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  57.36 
 
 		 897 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  59.15 
 
 		 872 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 975 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  55.94 
 
 		 954 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  58.44 
 
 		 994 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  56.98 
 
 		 993 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  56.98 
 
 		 899 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  57.45 
 
 		 886 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  56.69 
 
 		 888 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  57.92 
 
 		 896 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  56.88 
 
 		 955 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  55.35 
 
 		 910 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  58.91 
 
 		 1018 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  56.69 
 
 		 1009 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  52.2 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  57.74 
 
 		 904 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  56.95 
 
 		 932 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  55.51 
 
 		 903 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  56.77 
 
 		 930 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  57.45 
 
 		 838 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  58.37 
 
 		 834 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 936 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  53.39 
 
 		 897 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  56.32 
 
 		 944 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  56.95 
 
 		 931 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  56.14 
 
 		 934 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  56.95 
 
 		 931 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  57.09 
 
 		 912 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  56.77 
 
 		 936 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  56.32 
 
 		 947 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  56.08 
 
 		 864 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  56.77 
 
 		 936 aa  582  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  56.84 
 
 		 909 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 932 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  56.32 
 
 		 947 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 932 aa  582  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 932 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  55.64 
 
 		 934 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  56.58 
 
 		 932 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  56.32 
 
 		 947 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 968 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  54.2 
 
 		 919 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  56.9 
 
 		 917 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  56.31 
 
 		 921 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  56.32 
 
 		 866 aa  577  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  57.99 
 
 		 796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  56.1 
 
 		 917 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 934 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  54.89 
 
 		 924 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  55.17 
 
 		 962 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  55.17 
 
 		 962 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  55.17 
 
 		 962 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  56.6 
 
 		 908 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 930 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  56.1 
 
 		 917 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  54.74 
 
 		 912 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  55.7 
 
 		 921 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  57.06 
 
 		 908 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>