123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0275 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  227  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  49.04 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  48.51 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  48.51 
 
 
117 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  42.31 
 
 
112 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  41.58 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  46.88 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  44.66 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  44.66 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  41.75 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  42.55 
 
 
119 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  39 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3940  protein of unknown function DUF86  37.25 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2454  protein of unknown function DUF86  40.45 
 
 
89 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  35.64 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  39.78 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  41.84 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  39.8 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  34.62 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  36.79 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2417  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  39.58 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  36.63 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  37.76 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  31.68 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3961  hypothetical protein  31.73 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.333719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  34 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  37.23 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  41.77 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  38.89 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  35.42 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  36.73 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  35.87 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  34.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  34.65 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  35 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  31.63 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  37.25 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  32.29 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  30.69 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  38.78 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  34.29 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  32.32 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  32.32 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  32.67 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  38.3 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  32.63 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1297  hypothetical protein  39.53 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  33.67 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  33.67 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  30.53 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  38.67 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  38.38 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  38.14 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  38.14 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  36.63 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0203  protein of unknown function DUF86  30.69 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  32 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0846  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  42.42 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  25.71 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  31.31 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  29.59 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  30.61 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  34 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  34 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  31.78 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  36 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  34.69 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  32.1 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  33.66 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  33.66 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0274  hypothetical protein  34.34 
 
 
114 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0153  hypothetical protein  31 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5351  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1947  protein of unknown function DUF86  27.66 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1958  protein of unknown function DUF86  27.66 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.323925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  43.86 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0316  protein of unknown function DUF86  30.11 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  30.1 
 
 
112 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  34.02 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  30.93 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0698  hypothetical protein  38.67 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0872  protein of unknown function DUF86  25.27 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2193  hypothetical protein  32.99 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3150  protein of unknown function DUF86  30.69 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.75106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2886  hypothetical protein  31.63 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.116499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1103  hypothetical protein  32.32 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  26 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0280  protein of unknown function DUF86  37.1 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0704  protein of unknown function DUF86  27.45 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000073027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  27.55 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0034  protein of unknown function DUF86  39.39 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.225981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>