More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0264 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.97 
 
 
249 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.56 
 
 
249 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.35 
 
 
249 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.97 
 
 
249 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.97 
 
 
249 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  67.74 
 
 
249 aa  360  8e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.77 
 
 
248 aa  359  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.87 
 
 
246 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.66 
 
 
260 aa  318  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.55 
 
 
265 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.4 
 
 
260 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.75 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.75 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.18 
 
 
266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.71 
 
 
267 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.48 
 
 
259 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.97 
 
 
267 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
267 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.84 
 
 
267 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
256 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.64 
 
 
252 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.36 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.92 
 
 
247 aa  263  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.89 
 
 
259 aa  263  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.69 
 
 
256 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
264 aa  261  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
245 aa  261  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
251 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
263 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
266 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 
259 aa  256  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.51 
 
 
249 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.36 
 
 
249 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.07 
 
 
249 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.8 
 
 
258 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.79 
 
 
257 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
238 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
285 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
238 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
251 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
253 aa  248  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
276 aa  248  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
246 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
246 aa  248  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.97 
 
 
273 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  51.02 
 
 
259 aa  246  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.05 
 
 
256 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.03 
 
 
282 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
246 aa  244  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.26 
 
 
257 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
271 aa  242  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
276 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
251 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 
256 aa  241  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 
256 aa  241  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
256 aa  241  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
240 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.07 
 
 
267 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.23 
 
 
275 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
234 aa  240  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  47.54 
 
 
273 aa  239  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
252 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.05 
 
 
247 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.12 
 
 
222 aa  239  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.23 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
248 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.23 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.81 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.37 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
244 aa  239  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
275 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
275 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
266 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
264 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
240 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
260 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
258 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>