More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0142 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 464 aa  912    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  68.03 
 
 		 470 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  67.32 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  69.59 
 
 		 474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  65.6 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  65.08 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  65.08 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  61.75 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  51.45 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  50.62 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  50.65 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  47.65 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  44.81 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  44.61 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  46.42 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  45.66 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  46.09 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  45.25 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  41.49 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  40.79 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 403 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 		 399 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  40.36 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  41.88 
 
 		 735 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  40.09 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  40.71 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.71 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.54 
 
 		 530 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  44.99 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 533 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  38.7 
 
 		 761 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.71 
 
 		 532 aa  272  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  38.91 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.31 
 
 		 856 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 534 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  44.06 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  38.89 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.74 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.12 
 
 		 531 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  41.68 
 
 		 538 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  39.38 
 
 		 533 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.76 
 
 		 756 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  39.54 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  41.13 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  41.13 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.85 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.29 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  41.41 
 
 		 533 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  39.29 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.23 
 
 		 533 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 		 532 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.62 
 
 		 848 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  42.31 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.82 
 
 		 853 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.14 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.92 
 
 		 530 aa  262  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 		 748 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.85 
 
 		 849 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  40.7 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  42.76 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  38.32 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.85 
 
 		 532 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  42.46 
 
 		 533 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  40.7 
 
 		 759 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 		 525 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39.84 
 
 		 843 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.59 
 
 		 839 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  40.39 
 
 		 534 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.46 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  40.53 
 
 		 740 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.2 
 
 		 753 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 		 534 aa  253  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  38.93 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  42.03 
 
 		 533 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  38.14 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.81 
 
 		 512 aa  249  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.41 
 
 		 856 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  40.15 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.46 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.46 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  40.15 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 632 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  37.42 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  41.4 
 
 		 636 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  39.9 
 
 		 534 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  37.5 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  39.11 
 
 		 554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.29 
 
 		 604 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 556 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34 
 
 		 911 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.01 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>