85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0132 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  33.87 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.95 
 
 		 843 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  27.7 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  27.7 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  27.81 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  28.44 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  25 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  27.19 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  26.63 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  25.23 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  24.29 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  26.11 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.67 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  27.09 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  26.35 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  24.92 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  26.63 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  46.55 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.51 
 
 		 647 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  57.14 
 
 		 420 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  46.88 
 
 		 415 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  29.57 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  33.72 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  23.91 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.72 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  36.84 
 
 		 552 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  26.5 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  35.85 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  45.71 
 
 		 507 aa  46.2  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  55.81 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  41.18 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  36.62 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  56.1 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  35.53 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  40.7 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  39.68 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  49.12 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  56.1 
 
 		 619 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  52 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  56.1 
 
 		 616 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  32.77 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.98 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  56.1 
 
 		 619 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  35.82 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  29.93 
 
 		 492 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  54.76 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  36.76 
 
 		 537 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  32.26 
 
 		 556 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  32.71 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  47.27 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.86 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  26.14 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  59.46 
 
 		 624 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  39.68 
 
 		 490 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>