More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0098 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  66.18 
 
 
485 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  76.15 
 
 
589 aa  890    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  72.56 
 
 
592 aa  871    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  59.48 
 
 
596 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  68.86 
 
 
483 aa  648    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  68.3 
 
 
494 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  60 
 
 
597 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  100 
 
 
594 aa  1187    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  59.34 
 
 
580 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  75.9 
 
 
587 aa  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  75.76 
 
 
590 aa  889    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  77.16 
 
 
600 aa  909    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  74.23 
 
 
601 aa  893    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  59.48 
 
 
596 aa  685    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  60.45 
 
 
596 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  66.39 
 
 
485 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  64.48 
 
 
605 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  72.56 
 
 
592 aa  871    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  49.22 
 
 
583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  50.52 
 
 
588 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.84 
 
 
583 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  46.72 
 
 
585 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  48.08 
 
 
578 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  48.02 
 
 
583 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  46.84 
 
 
584 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  49.66 
 
 
587 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  48.29 
 
 
585 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  48.53 
 
 
582 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  47.86 
 
 
585 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.75 
 
 
580 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  47.51 
 
 
585 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  47.68 
 
 
585 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  47.86 
 
 
585 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  45.85 
 
 
580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  47.34 
 
 
585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  48.45 
 
 
585 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  47.49 
 
 
577 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  45.69 
 
 
585 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.77 
 
 
586 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  45.17 
 
 
585 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  45.16 
 
 
581 aa  504  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  45.17 
 
 
585 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  44.14 
 
 
590 aa  495  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  43.65 
 
 
580 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  44.43 
 
 
589 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  43.66 
 
 
582 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  44.12 
 
 
582 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  52.42 
 
 
471 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  50.84 
 
 
474 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  51.37 
 
 
478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  50.42 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  50.62 
 
 
479 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  49.68 
 
 
496 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  49.58 
 
 
474 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  48.3 
 
 
482 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  49.25 
 
 
476 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  48.83 
 
 
496 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  46.51 
 
 
476 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  48.83 
 
 
480 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  48.41 
 
 
471 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  48.3 
 
 
480 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  46.33 
 
 
472 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  47.55 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  47.76 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  48.94 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  46.12 
 
 
472 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  48.39 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  46.92 
 
 
472 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  48.41 
 
 
472 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  48.19 
 
 
481 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  46.88 
 
 
471 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  46.74 
 
 
487 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  48.41 
 
 
472 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  48.39 
 
 
482 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  48.41 
 
 
472 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  49.68 
 
 
474 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  48.41 
 
 
472 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  47.75 
 
 
505 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  45.63 
 
 
474 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  48.51 
 
 
472 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  45.44 
 
 
472 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  46.82 
 
 
474 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  45 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  44.16 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  48.09 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  47.26 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  48.31 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  46.3 
 
 
467 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  43.88 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  45.88 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  43.46 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  47.79 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  44.73 
 
 
474 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  47.53 
 
 
476 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  44.14 
 
 
479 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>