241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0097 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  34.64 
 
 
1256 aa  739  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  45.98 
 
 
1263 aa  1099  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  47.91 
 
 
1253 aa  1122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  40.44 
 
 
1453 aa  922  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  39.54 
 
 
1194 aa  859  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  34.62 
 
 
1220 aa  758  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  46.25 
 
 
1273 aa  1094  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  44.65 
 
 
1293 aa  1077  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  47.42 
 
 
1248 aa  1112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  46.21 
 
 
1263 aa  1092  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  40.58 
 
 
1409 aa  916  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  40.98 
 
 
1266 aa  880  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  46.55 
 
 
1235 aa  1060  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  40.83 
 
 
1222 aa  876  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  1.25335e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  41.95 
 
 
1435 aa  977  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  40.17 
 
 
1253 aa  966  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  3.27208e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  46.74 
 
 
1248 aa  1082  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  39.87 
 
 
1222 aa  863  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  39.75 
 
 
1190 aa  823  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  40.91 
 
 
1198 aa  866  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  39.67 
 
 
1205 aa  882  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  45.93 
 
 
1220 aa  1085  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  36.54 
 
 
1245 aa  877  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  38.9 
 
 
1245 aa  937  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  37.91 
 
 
1262 aa  918  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  43.65 
 
 
1259 aa  974  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  46 
 
 
1220 aa  1088  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  47.69 
 
 
1281 aa  1147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  47.84 
 
 
1281 aa  1147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  40.91 
 
 
1198 aa  867  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  46 
 
 
1220 aa  1088  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  36.62 
 
 
1245 aa  880  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  38.89 
 
 
1213 aa  858  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  47.97 
 
 
1273 aa  1098  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07872e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  48.18 
 
 
1269 aa  1150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  47.97 
 
 
1253 aa  1125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  38.46 
 
 
1175 aa  733  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  39.92 
 
 
1238 aa  891  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  47.53 
 
 
1253 aa  1233  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  38.55 
 
 
1199 aa  814  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  61.42 
 
 
1247 aa  1560  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  32.11 
 
 
1302 aa  680  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  40.56 
 
 
1212 aa  852  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  34.2 
 
 
1293 aa  642  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  41.98 
 
 
1203 aa  897  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  39.79 
 
 
1207 aa  852  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  33.53 
 
 
1298 aa  675  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  39.84 
 
 
1206 aa  858  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  40.95 
 
 
1191 aa  895  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  40.29 
 
 
1196 aa  840  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  37.64 
 
 
1207 aa  813  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  40.38 
 
 
1193 aa  857  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  42.99 
 
 
1426 aa  998  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  47.78 
 
 
1253 aa  1123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  47.64 
 
 
1269 aa  1159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  48.03 
 
 
1270 aa  1153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  47.59 
 
 
1267 aa  1141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  47.29 
 
 
1269 aa  1124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  8.11844e-06 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  34.86 
 
 
1259 aa  726  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  45.8 
 
 
1249 aa  1009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  34.93 
 
 
1258 aa  743  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  49.34 
 
 
1330 aa  992  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  61.74 
 
 
1247 aa  1576  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  59.67 
 
 
1261 aa  1516  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  40.65 
 
 
1406 aa  903  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  60.38 
 
 
1348 aa  809  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  46.17 
 
 
1260 aa  1080  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  32.88 
 
 
1304 aa  655  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  60.8 
 
 
1290 aa  1575  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  47.52 
 
 
1269 aa  1142  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  39.49 
 
 
1364 aa  773  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  47.64 
 
 
1269 aa  1157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  46 
 
 
1220 aa  1088  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  47.53 
 
 
1254 aa  1149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  45.9 
 
 
1263 aa  1097  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  48.19 
 
 
1278 aa  1148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  47.93 
 
 
1240 aa  1070  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  56.33 
 
 
1363 aa  1555  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  40.9 
 
 
1444 aa  900  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  48.53 
 
 
1254 aa  1163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  47.66 
 
 
1247 aa  1026  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  47.69 
 
 
1281 aa  1148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  48.22 
 
 
1267 aa  1132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  61.75 
 
 
1288 aa  1605  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  34.28 
 
 
1255 aa  746  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  36.93 
 
 
1245 aa  882  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  45.88 
 
 
1286 aa  1006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  38.22 
 
 
1262 aa  927  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  39.62 
 
 
1209 aa  841  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1263 aa  2565  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  47.99 
 
 
1253 aa  1123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  41.75 
 
 
1237 aa  966  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  40.91 
 
 
1198 aa  866  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  35.93 
 
 
1244 aa  833  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  32.96 
 
 
1244 aa  656  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  47.64 
 
 
1269 aa  1157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  44.36 
 
 
1256 aa  974  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  47.65 
 
 
1248 aa  1115  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  48.19 
 
 
1270 aa  1151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  43.46 
 
 
1242 aa  963  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>