More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0095 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.97 
 
 
246 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  92.24 
 
 
247 aa  444  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  90.56 
 
 
257 aa  444  1e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.38 
 
 
246 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.6 
 
 
263 aa  440  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.38 
 
 
246 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  90.95 
 
 
247 aa  437  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  75.82 
 
 
268 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  75.31 
 
 
262 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  75.31 
 
 
259 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  72.36 
 
 
258 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  72.2 
 
 
265 aa  370  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  72.2 
 
 
265 aa  370  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  70.28 
 
 
260 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  69.88 
 
 
260 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  70.28 
 
 
260 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  70.73 
 
 
260 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 
235 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  188  6e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  188  6e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 
230 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
226 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  4.0546e-10 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
226 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
230 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 
236 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
245 aa  184  1e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
236 aa  184  1e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
231 aa  184  1e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
231 aa  184  1e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 
237 aa  184  2e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
226 aa  184  2e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.28 
 
 
234 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39 
 
 
243 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 
234 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
245 aa  182  4e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
242 aa  182  4e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
242 aa  182  4e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.05 
 
 
239 aa  182  4e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 
247 aa  182  4e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
231 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  2.82114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
225 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
243 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
230 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.15 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 
230 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
226 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.56 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.56 
 
 
239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 
238 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 
232 aa  179  3e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  42.15 
 
 
239 aa  179  3e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44 
 
 
231 aa  179  3e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 
236 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
255 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 
248 aa  179  5e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  41.03 
 
 
248 aa  179  5e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  41.03 
 
 
248 aa  179  5e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  179  5e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
259 aa  178  6e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
248 aa  178  6e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
237 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
235 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
235 aa  178  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 
243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 
239 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  41.53 
 
 
236 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 
234 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 
243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.56 
 
 
231 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 
227 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
229 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
232 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  40.6 
 
 
248 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 
235 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  39.74 
 
 
248 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
234 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 
226 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
229 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 
244 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  39.91 
 
 
248 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 
237 aa  174  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
230 aa  174  1e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 
248 aa  174  1e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 
236 aa  173  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 
229 aa  172  3e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
229 aa  172  4e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>