More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0093 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  51 
 
 
225 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  48.31 
 
 
211 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  46.86 
 
 
209 aa  197  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  50 
 
 
234 aa  197  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  55.87 
 
 
209 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.87 
 
 
217 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  50 
 
 
209 aa  183  2e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.06 
 
 
210 aa  182  4e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  45.16 
 
 
215 aa  181  9e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.75 
 
 
213 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.15 
 
 
204 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.98 
 
 
207 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22791e-05 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  46.48 
 
 
214 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  54.75 
 
 
216 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  43.54 
 
 
215 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  46.26 
 
 
212 aa  174  1e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.17 
 
 
213 aa  173  2e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.94 
 
 
213 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.33636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.5 
 
 
207 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  46.92 
 
 
212 aa  168  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.73 
 
 
244 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  42.11 
 
 
212 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.64 
 
 
217 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  39.23 
 
 
212 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  46.73 
 
 
244 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  47.4 
 
 
233 aa  166  3e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2842e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.97 
 
 
216 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  47.69 
 
 
226 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  48.5 
 
 
705 aa  164  7e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.4 
 
 
205 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  40.19 
 
 
212 aa  164  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  40.54 
 
 
223 aa  163  1e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.45 
 
 
686 aa  164  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  41.58 
 
 
210 aa  164  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.32 
 
 
707 aa  163  2e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  47.6 
 
 
213 aa  163  2e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  48.58 
 
 
217 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.07 
 
 
215 aa  163  2e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.93 
 
 
901 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.45 
 
 
224 aa  162  5e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.65 
 
 
211 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  47 
 
 
703 aa  161  8e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.91 
 
 
206 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.08 
 
 
688 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  40.85 
 
 
210 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.46 
 
 
208 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  41.83 
 
 
211 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.39 
 
 
202 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.39 
 
 
221 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  47.87 
 
 
662 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  45.45 
 
 
206 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  41.83 
 
 
211 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  44.13 
 
 
221 aa  158  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  48.26 
 
 
236 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.18 
 
 
222 aa  157  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.97 
 
 
217 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.6403e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.55 
 
 
671 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  46.41 
 
 
243 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.28 
 
 
219 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.78 
 
 
207 aa  155  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.6 
 
 
686 aa  155  5e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  48.06 
 
 
225 aa  155  5e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  47.39 
 
 
210 aa  155  5e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.93 
 
 
207 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.66 
 
 
212 aa  154  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.72 
 
 
210 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  44.98 
 
 
281 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.01 
 
 
214 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  47.09 
 
 
217 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  47.09 
 
 
217 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.3 
 
 
208 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  43.93 
 
 
209 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.19 
 
 
688 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.45 
 
 
207 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.17 
 
 
218 aa  151  6e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.22 
 
 
217 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  46.05 
 
 
217 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.65 
 
 
219 aa  151  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  42.4 
 
 
225 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45.37 
 
 
240 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.63 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  42.44 
 
 
222 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.73 
 
 
199 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  42.79 
 
 
295 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.02 
 
 
203 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.39 
 
 
208 aa  148  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  41.31 
 
 
209 aa  148  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  44.55 
 
 
208 aa  148  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.34 
 
 
210 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  44.65 
 
 
214 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  41.94 
 
 
225 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  44.29 
 
 
226 aa  147  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.23 
 
 
222 aa  147  1e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40.47 
 
 
211 aa  147  1e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  45.33 
 
 
225 aa  147  1e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  35.58 
 
 
211 aa  147  2e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  39.55 
 
 
217 aa  146  2e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  38.07 
 
 
217 aa  146  2e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  39.55 
 
 
217 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>