23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0091 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0091  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  404  1e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  71.35 
 
 
203 aa  271  4e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1289  protein of unknown function DUF564  64.43 
 
 
201 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  65.45 
 
 
201 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  67.93 
 
 
209 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1318  protein of unknown function DUF564  63.92 
 
 
201 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.542836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3700  hypothetical protein  64 
 
 
208 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  65.38 
 
 
205 aa  252  2e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2547  hypothetical protein  52.69 
 
 
178 aa  168  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44205  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21461  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  43.58 
 
 
195 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.901505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1275  hypothetical protein  43.02 
 
 
195 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2199  hypothetical protein  46.99 
 
 
193 aa  165  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29001  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  47.88 
 
 
178 aa  155  5e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  42.29 
 
 
206 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18031  hypothetical protein  44.81 
 
 
158 aa  147  1e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  41.36 
 
 
180 aa  145  4e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1768  hypothetical protein  41.56 
 
 
166 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18851  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  41.56 
 
 
167 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.801605  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40512  predicted protein  44.32 
 
 
247 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143687  normal  0.760886 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35045  predicted protein  39.89 
 
 
214 aa  117  8e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132422  normal  0.23655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  28.73 
 
 
524 aa  54.3  1e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  28.3 
 
 
509 aa  50.4  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  28.12 
 
 
515 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>