35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0088 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  491  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  55.8 
 
 
228 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  54.34 
 
 
226 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  54.34 
 
 
226 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  52.21 
 
 
227 aa  252  4e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  56.65 
 
 
207 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  51.34 
 
 
246 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  54.46 
 
 
257 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2093  hypothetical protein  36.04 
 
 
219 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0578  hypothetical protein  36.55 
 
 
219 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.976371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05701  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  118  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13751  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
290 aa  69.3  5e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 
290 aa  68.9  6e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  24.79 
 
 
298 aa  67.4  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  22.37 
 
 
289 aa  65.5  7e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 
299 aa  62  8e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
289 aa  60.8  2e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
289 aa  60.8  2e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  23.33 
 
 
304 aa  58.2  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 
270 aa  55.8  6e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  31.1 
 
 
270 aa  53.5  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 
269 aa  53.1  4e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
293 aa  50.4  3e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  24.69 
 
 
429 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  55 
 
 
363 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  29.01 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  30.16 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  60.61 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 
275 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  44.9 
 
 
337 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>