35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0088 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  55.8 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  54.34 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  54.34 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  52.21 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  56.65 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  51.34 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  54.46 
 
 		 257 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2093  hypothetical protein  36.04 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0578  hypothetical protein  36.55 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.976371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05701  hypothetical protein  37.44 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13751  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  22.37 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  23.33 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  31.1 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  24.69 
 
 		 429 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  55 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  29.01 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  30.16 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  60.61 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  27.64 
 
 		 275 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  44.9 
 
 		 337 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>