65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0087 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  979  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  50.41 
 
 
491 aa  452  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  47.59 
 
 
494 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  47.59 
 
 
494 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  47.02 
 
 
493 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  50.94 
 
 
491 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  44.69 
 
 
499 aa  417  1e-115  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  49.67 
 
 
493 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  34.3 
 
 
499 aa  202  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  33.89 
 
 
492 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  34.83 
 
 
505 aa  185  1e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  32.5 
 
 
493 aa  184  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  34.59 
 
 
501 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  34.59 
 
 
501 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  30.91 
 
 
500 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  38.17 
 
 
322 aa  180  6e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  32.77 
 
 
504 aa  175  2e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  5.7775e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  34.03 
 
 
369 aa  174  3e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  32.49 
 
 
369 aa  173  8e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  33.52 
 
 
364 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  37.3 
 
 
315 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  38.12 
 
 
315 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  37.33 
 
 
326 aa  166  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  36.99 
 
 
315 aa  165  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  37.67 
 
 
342 aa  165  2e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  37.7 
 
 
550 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  35.47 
 
 
342 aa  156  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  36.9 
 
 
350 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  37.16 
 
 
381 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  34.73 
 
 
378 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  37.54 
 
 
341 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  36.68 
 
 
392 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  34.53 
 
 
330 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  31.58 
 
 
379 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  31.99 
 
 
388 aa  140  5e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  35.23 
 
 
317 aa  140  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  31.1 
 
 
378 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  43.72 
 
 
397 aa  137  6e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  30.63 
 
 
420 aa  135  2e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  36.63 
 
 
383 aa  133  7e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  34.16 
 
 
399 aa  129  1e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  35.1 
 
 
368 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  41.81 
 
 
423 aa  122  2e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  34.01 
 
 
388 aa  119  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  39.34 
 
 
422 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  29.27 
 
 
684 aa  93.6  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  28.97 
 
 
834 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  34.74 
 
 
239 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  30.33 
 
 
365 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  29.51 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  29.51 
 
 
365 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  2.35959e-09 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  33.68 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  29.51 
 
 
365 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  28.69 
 
 
365 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.45815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  35.53 
 
 
241 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  27.65 
 
 
313 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.15843e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  27.87 
 
 
365 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  27.87 
 
 
365 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.73699e-11 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  27.87 
 
 
365 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  27.87 
 
 
365 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>