More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0086 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  58.25 
 
 		 694 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  56.37 
 
 		 708 aa  797    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  56.51 
 
 		 706 aa  801    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  48.76 
 
 		 692 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  48.2 
 
 		 721 aa  646    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  100 
 
 		 694 aa  1438    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  58.25 
 
 		 694 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  58.27 
 
 		 695 aa  783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  57.53 
 
 		 705 aa  835    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  58.04 
 
 		 693 aa  785    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  60.23 
 
 		 693 aa  868    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  58 
 
 		 696 aa  785    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  48.18 
 
 		 693 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  50.95 
 
 		 686 aa  726    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  46.88 
 
 		 704 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  44.01 
 
 		 774 aa  626  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 701 aa  625  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  47.84 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 		 724 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  43.94 
 
 		 689 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.62 
 
 		 718 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  43.93 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 729 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  43.88 
 
 		 686 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  44.38 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 723 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  44.03 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  48 
 
 		 671 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  41.12 
 
 		 677 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  40.35 
 
 		 677 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  46.25 
 
 		 712 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  46.23 
 
 		 706 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  45.83 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.68 
 
 		 708 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  40.35 
 
 		 677 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  45.69 
 
 		 712 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  44.99 
 
 		 708 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  40.65 
 
 		 668 aa  552  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 711 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  46.71 
 
 		 701 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  47.6 
 
 		 727 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  46.64 
 
 		 715 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  45.94 
 
 		 710 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  44.8 
 
 		 712 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.8 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  46.1 
 
 		 709 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  45.26 
 
 		 707 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  44.71 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.72 
 
 		 711 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  45.09 
 
 		 690 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  45.19 
 
 		 721 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 726 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  47.65 
 
 		 703 aa  535  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 		 720 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  43.91 
 
 		 705 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  41.91 
 
 		 765 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.79 
 
 		 751 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  45.15 
 
 		 703 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  43.66 
 
 		 718 aa  532  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.38 
 
 		 700 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.93 
 
 		 779 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  44 
 
 		 714 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 722 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  45.01 
 
 		 722 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  45.26 
 
 		 721 aa  528  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  43.28 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  43.41 
 
 		 716 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  40.84 
 
 		 730 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  46.77 
 
 		 701 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  45.24 
 
 		 704 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.03 
 
 		 755 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  43.86 
 
 		 720 aa  525  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  44.41 
 
 		 715 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  49.66 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  44.09 
 
 		 758 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  44.44 
 
 		 758 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.72 
 
 		 707 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.47 
 
 		 1537 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  43.31 
 
 		 723 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 718 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  46.69 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  44.17 
 
 		 756 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 730 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  50.59 
 
 		 720 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.97 
 
 		 701 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  42.94 
 
 		 722 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  47.08 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.66 
 
 		 752 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  45.43 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 757 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  43.71 
 
 		 733 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  49.41 
 
 		 776 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  43.57 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.87 
 
 		 719 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  45.93 
 
 		 701 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>