More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0085 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  100 
 
 
228 aa  469  1e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  49.52 
 
 
218 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  45.29 
 
 
223 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  50.23 
 
 
235 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.13 
 
 
232 aa  197  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  48.87 
 
 
227 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  48.34 
 
 
248 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.98 
 
 
229 aa  182  5e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  48.37 
 
 
229 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.73 
 
 
232 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.73 
 
 
228 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.87 
 
 
214 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  42.24 
 
 
230 aa  172  3e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  47.24 
 
 
245 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.99 
 
 
223 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.97 
 
 
228 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  46.23 
 
 
219 aa  166  3e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
212 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  42.86 
 
 
208 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.16 
 
 
231 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  41.44 
 
 
225 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  40.19 
 
 
242 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  45.5 
 
 
204 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45 
 
 
230 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  41.23 
 
 
219 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  46.4 
 
 
230 aa  152  3e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  44.5 
 
 
230 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.85 
 
 
230 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  0.049198 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  42.72 
 
 
227 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.55 
 
 
226 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  43.32 
 
 
223 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  42.79 
 
 
217 aa  147  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  36.79 
 
 
214 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  41.78 
 
 
218 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  44.2 
 
 
228 aa  145  7e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  36.87 
 
 
230 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  38.89 
 
 
222 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  43.96 
 
 
228 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  40.54 
 
 
227 aa  140  2e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  39.73 
 
 
228 aa  139  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  41.51 
 
 
216 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.97 
 
 
223 aa  139  5e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  40 
 
 
237 aa  138  8e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
223 aa  138  8e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.13 
 
 
223 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  41.31 
 
 
217 aa  136  3e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
233 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  37.33 
 
 
228 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 
228 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  34.4 
 
 
230 aa  135  6e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  38.05 
 
 
223 aa  135  7e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  38.05 
 
 
223 aa  134  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  36.45 
 
 
224 aa  134  1e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  40.66 
 
 
227 aa  134  1e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 
219 aa  133  2e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  37.81 
 
 
215 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  39.35 
 
 
230 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.78 
 
 
229 aa  131  7e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.86 
 
 
229 aa  131  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.72 
 
 
229 aa  130  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.46 
 
 
240 aa  130  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.91 
 
 
231 aa  129  4e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  40.18 
 
 
225 aa  129  4e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.01 
 
 
229 aa  129  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.24 
 
 
231 aa  127  1e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0467  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
219 aa  126  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530029  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  33.49 
 
 
229 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  38.21 
 
 
224 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
218 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  33.64 
 
 
222 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
255 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  35.6 
 
 
224 aa  121  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  121  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  40.11 
 
 
217 aa  120  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
233 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
244 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
244 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
228 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  37.62 
 
 
225 aa  119  4e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
214 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  34.4 
 
 
230 aa  118  8e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
260 aa  117  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.38 
 
 
214 aa  117  2e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
228 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  33.19 
 
 
223 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
252 aa  115  8e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  114  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  32.26 
 
 
221 aa  114  1e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
240 aa  114  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
240 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  31.31 
 
 
221 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  34.41 
 
 
222 aa  112  4e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  30.37 
 
 
221 aa  112  4e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>