More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0080 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  100 
 
 
407 aa  796  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  64.2 
 
 
405 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  63.7 
 
 
405 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  62.87 
 
 
409 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  60.89 
 
 
409 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  58.17 
 
 
405 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  60.85 
 
 
409 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  61.6 
 
 
409 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  57.78 
 
 
405 aa  470  1e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  60.2 
 
 
409 aa  466  1e-130  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  60.2 
 
 
409 aa  466  1e-130  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  58.17 
 
 
405 aa  461  1e-128  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  58.17 
 
 
405 aa  461  1e-128  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  57.39 
 
 
410 aa  461  1e-128  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  58.69 
 
 
398 aa  461  1e-128  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  57.39 
 
 
410 aa  460  1e-128  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  56.05 
 
 
409 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  51.85 
 
 
405 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  51.85 
 
 
405 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  50.12 
 
 
403 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  42.16 
 
 
443 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  44.55 
 
 
409 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  43.9 
 
 
423 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  41.67 
 
 
405 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  44.31 
 
 
409 aa  285  1e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  42.47 
 
 
400 aa  284  2e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  43.42 
 
 
404 aa  284  2e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.16 
 
 
405 aa  284  2e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43.81 
 
 
409 aa  283  3e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57118e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.93 
 
 
409 aa  283  3e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  42.86 
 
 
400 aa  284  3e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  42.28 
 
 
414 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 
406 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.72644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  41.25 
 
 
415 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  40.83 
 
 
406 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  43.81 
 
 
405 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  42.05 
 
 
401 aa  275  1e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  41.34 
 
 
406 aa  274  2e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  43.96 
 
 
410 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  43.52 
 
 
408 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.95 
 
 
408 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  42.39 
 
 
394 aa  268  9e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  41.52 
 
 
411 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40 
 
 
644 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  39.26 
 
 
401 aa  267  3e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  40.35 
 
 
406 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  43.7 
 
 
406 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  42.82 
 
 
409 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  42.71 
 
 
402 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  45.57 
 
 
431 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  42.93 
 
 
414 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.65799e-05 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 
401 aa  262  7e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  40.79 
 
 
401 aa  262  7e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
406 aa  262  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  39.36 
 
 
402 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  40.05 
 
 
401 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  41.08 
 
 
403 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  40.59 
 
 
661 aa  259  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40.63 
 
 
411 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  41.77 
 
 
409 aa  254  1e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  40.55 
 
 
402 aa  254  2e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  41.77 
 
 
409 aa  254  2e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  41.44 
 
 
647 aa  254  2e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40.99 
 
 
671 aa  254  2e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  40.15 
 
 
400 aa  253  4e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  41.56 
 
 
409 aa  253  5e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  36.11 
 
 
715 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  41.5 
 
 
651 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
658 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  38.83 
 
 
391 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.12 
 
 
656 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.06 
 
 
412 aa  249  7e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  37.56 
 
 
657 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  38.2 
 
 
652 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 
402 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  40.79 
 
 
402 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  41.94 
 
 
403 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 
400 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  38.35 
 
 
412 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
398 aa  244  2e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.53 
 
 
394 aa  244  2e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  39 
 
 
394 aa  244  2e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.4 
 
 
653 aa  244  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.86 
 
 
409 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  39.8 
 
 
400 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 
420 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 
420 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 
410 aa  242  8e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  39.36 
 
 
409 aa  242  8e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  40.49 
 
 
653 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.57 
 
 
403 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.66 
 
 
663 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  39.61 
 
 
420 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  40.84 
 
 
681 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  40.84 
 
 
681 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  38.92 
 
 
656 aa  240  3e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  39.8 
 
 
696 aa  240  3e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.02561e-08  unclonable  1.13397e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  39.22 
 
 
648 aa  239  7e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  39.22 
 
 
648 aa  239  7e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  39.9 
 
 
652 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>