294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0078 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  1e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  57.43 
 
 
139 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  57.72 
 
 
138 aa  182  1e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  59.18 
 
 
137 aa  181  4e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  1.35956e-06 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  58.11 
 
 
138 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  58.11 
 
 
138 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  58.78 
 
 
137 aa  177  5e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  55.7 
 
 
138 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  48.99 
 
 
212 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  49.3 
 
 
140 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  52.11 
 
 
140 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  53.02 
 
 
166 aa  146  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  48.99 
 
 
139 aa  146  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1825  hypothetical protein  44.3 
 
 
153 aa  145  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05491  hypothetical protein  44.3 
 
 
153 aa  145  2e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.985204  normal  0.552245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  50.37 
 
 
157 aa  145  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  48.32 
 
 
140 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  49.3 
 
 
156 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  51.06 
 
 
160 aa  144  4e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  48.94 
 
 
140 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  49.65 
 
 
160 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  49.32 
 
 
160 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  48.32 
 
 
139 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  48.3 
 
 
139 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 
140 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  50.35 
 
 
140 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  48.98 
 
 
144 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  45.95 
 
 
143 aa  140  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  52.03 
 
 
166 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  48.94 
 
 
160 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  44.59 
 
 
151 aa  139  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  46.31 
 
 
139 aa  139  2e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  5.52293e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  49.65 
 
 
157 aa  137  4e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  51.94 
 
 
126 aa  137  5e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  46.9 
 
 
138 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  46.31 
 
 
139 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  4.7058e-07 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  43.62 
 
 
139 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  45.64 
 
 
139 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  44.97 
 
 
142 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  44.97 
 
 
139 aa  133  7e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  44.97 
 
 
139 aa  133  7e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  53.23 
 
 
157 aa  133  7e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  44.97 
 
 
139 aa  133  7e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  44.97 
 
 
139 aa  133  7e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  52.42 
 
 
157 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  44.3 
 
 
140 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  46.1 
 
 
155 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  46.31 
 
 
139 aa  132  2e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  44.97 
 
 
139 aa  132  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  46.62 
 
 
143 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  45.71 
 
 
139 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  46.62 
 
 
143 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  43.15 
 
 
150 aa  129  1e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  43.15 
 
 
139 aa  129  1e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  44.3 
 
 
139 aa  129  1e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  47.18 
 
 
195 aa  128  2e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  45.95 
 
 
140 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  43.57 
 
 
139 aa  126  1e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  46.04 
 
 
139 aa  125  1e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  44.37 
 
 
139 aa  126  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  43.57 
 
 
139 aa  126  1e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  43.57 
 
 
139 aa  126  1e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  44.37 
 
 
144 aa  125  2e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  43.57 
 
 
139 aa  125  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  45.95 
 
 
205 aa  125  2e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  50.4 
 
 
157 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  45.89 
 
 
148 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  44.14 
 
 
140 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  43.42 
 
 
142 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  45.21 
 
 
159 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  42.45 
 
 
141 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  43.54 
 
 
139 aa  118  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  43.84 
 
 
139 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  39.33 
 
 
140 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  45.21 
 
 
139 aa  117  8e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  40.14 
 
 
139 aa  116  1e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  41.89 
 
 
139 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  38.78 
 
 
139 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  43.92 
 
 
141 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  43.54 
 
 
139 aa  113  1e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  41.1 
 
 
141 aa  113  1e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 
139 aa  112  2e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  42 
 
 
141 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  40.41 
 
 
141 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  42.07 
 
 
140 aa  109  1e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  43.15 
 
 
141 aa  109  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  36.99 
 
 
139 aa  108  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  43.24 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  38.78 
 
 
138 aa  107  4e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.147621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>