More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0076 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0076  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
253 aa  506  1e-142  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  38.5 
 
 
282 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 
260 aa  117  2e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.99609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.94 
 
 
259 aa  113  4e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.30479e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  112  7e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.52358e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  111  1e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.03966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  110  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.78527e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  111  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.39221e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  9.88465e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.86 
 
 
513 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.01 
 
 
259 aa  110  2e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.38178e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.4 
 
 
259 aa  110  2e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
261 aa  108  7e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  30.64 
 
 
246 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
247 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  30.49 
 
 
244 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
259 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.49 
 
 
281 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  30.67 
 
 
244 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
260 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.61301e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 
247 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  30.8 
 
 
501 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.33402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.37 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.0347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  27.98 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  29.26 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
276 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  29.2 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
264 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.84393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 
250 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.7 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  29.2 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.27 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 
250 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.72 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  28.76 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  29.82 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.74 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.67 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.21 
 
 
253 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.05 
 
 
263 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  27.83 
 
 
248 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
273 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  28.02 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  29.95 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  28.51 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  26.61 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  1.43889e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  25.22 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.70582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.95 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.46 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  27.31 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.69 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.56347e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.45333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  4.31676e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  28.12 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.97 
 
 
276 aa  89  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.39011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  28.05 
 
 
272 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  8.02311e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.35 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  2.66261e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  27.87 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
277 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.93 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.47 
 
 
501 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.6628e-28 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.55 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 
252 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0887  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.91 
 
 
260 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  7.33431e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.69 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.35 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.6 
 
 
248 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>