29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0070 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.21 
 
 
193 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.21 
 
 
193 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  47.92 
 
 
197 aa  164  6e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.32 
 
 
193 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  49.48 
 
 
194 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.55 
 
 
201 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  36.76 
 
 
189 aa  131  7e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  39.15 
 
 
189 aa  118  4e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  36.17 
 
 
192 aa  115  4e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.44 
 
 
184 aa  107  9e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.60604e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  34.11 
 
 
220 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  32.28 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  31.22 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  30.85 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  30.32 
 
 
180 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  31.22 
 
 
183 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  32.57 
 
 
303 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  30.11 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  33.33 
 
 
282 aa  50.1  2e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  25.64 
 
 
182 aa  48.1  7e-05  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0048  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.17 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892754  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  23.73 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  23.73 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.4 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.12 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.87 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  29.08 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.5 
 
 
213 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>