57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0067 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  100 
 
 
269 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  52.34 
 
 
260 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 
261 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  2.90694e-09 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 
261 aa  233  2e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  52.14 
 
 
266 aa  231  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  50.39 
 
 
267 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  49.81 
 
 
270 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  51.15 
 
 
270 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.95 
 
 
256 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
235 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.98 
 
 
240 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.74491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  28.69 
 
 
235 aa  92.4  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.79866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.05 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  31.84 
 
 
287 aa  84  3e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
234 aa  80.9  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
244 aa  79  7e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  26.5 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 
242 aa  75.1  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
242 aa  74.3  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
235 aa  73.9  2e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
256 aa  73.6  3e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  35.48 
 
 
736 aa  73.2  4e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  27.27 
 
 
244 aa  70.9  2e-11  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.9 
 
 
244 aa  70.5  2e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
244 aa  70.5  3e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  30.42 
 
 
240 aa  68.9  7e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.91 
 
 
260 aa  68.9  9e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.77 
 
 
254 aa  68.6  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
244 aa  67.8  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  30.6 
 
 
242 aa  67  3e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  2.87593e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  29.39 
 
 
244 aa  66.6  4e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  30.15 
 
 
244 aa  65.9  7e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.85 
 
 
748 aa  65.5  8e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28.08 
 
 
243 aa  65.5  8e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 
250 aa  65.5  9e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  29.62 
 
 
244 aa  65.1  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  29.34 
 
 
244 aa  63.5  4e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.84 
 
 
247 aa  62.8  6e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  32.52 
 
 
242 aa  62.4  7e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
768 aa  61.6  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  25.77 
 
 
244 aa  60.8  2e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  32.22 
 
 
770 aa  60.5  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  29.1 
 
 
244 aa  60.1  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 
234 aa  58.2  1e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  27.44 
 
 
248 aa  56.2  6e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  37.07 
 
 
891 aa  56.2  6e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  27.65 
 
 
240 aa  54.7  2e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  37.07 
 
 
964 aa  53.9  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  22.16 
 
 
248 aa  52.4  8e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
242 aa  52  1e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.51 
 
 
767 aa  50.8  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  29.57 
 
 
972 aa  49.3  6e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  25.26 
 
 
247 aa  48.9  8e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.91382e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  34.51 
 
 
977 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  24.15 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.83 
 
 
382 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>