More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0065 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
184 aa  376  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  82.14 
 
 
177 aa  292  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  81.55 
 
 
177 aa  290  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  76.19 
 
 
179 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  78.16 
 
 
177 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  69.49 
 
 
178 aa  268  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  76.79 
 
 
176 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  76.79 
 
 
176 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  68.13 
 
 
217 aa  247  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 
202 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  67.58 
 
 
219 aa  243  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 
217 aa  243  1e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20901  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 
202 aa  243  1e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.240556  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18251  translation initiation factor IF-3  67.58 
 
 
195 aa  242  2e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 
190 aa  241  4e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1215  translation initiation factor IF-3  66.48 
 
 
202 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  65.38 
 
 
190 aa  240  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  65.93 
 
 
190 aa  239  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  53.98 
 
 
202 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 
164 aa  198  4e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
187 aa  194  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
199 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
227 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  50.84 
 
 
243 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  61.44 
 
 
165 aa  188  3e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 
250 aa  187  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  53.37 
 
 
179 aa  188  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.56 
 
 
222 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  49.16 
 
 
194 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.72 
 
 
194 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  52.76 
 
 
401 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  49.16 
 
 
194 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  51.72 
 
 
396 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  50.56 
 
 
356 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.87235e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  55.62 
 
 
173 aa  184  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  58.17 
 
 
154 aa  184  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 
277 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 
357 aa  183  1e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 
415 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  47.75 
 
 
212 aa  181  4e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
233 aa  181  5e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 
204 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
171 aa  180  9e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 
192 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  52.15 
 
 
164 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.14962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 
205 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  49.73 
 
 
249 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 
198 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  50.3 
 
 
329 aa  178  5e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  52.98 
 
 
225 aa  178  5e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
202 aa  177  6e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  60 
 
 
145 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.06668e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 
178 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  51.59 
 
 
182 aa  174  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  52.23 
 
 
179 aa  174  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 
178 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
172 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 
178 aa  173  1e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 
219 aa  173  1e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
190 aa  173  1e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.48528e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  46.96 
 
 
238 aa  173  1e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  46.96 
 
 
238 aa  173  1e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  46.96 
 
 
238 aa  173  1e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
173 aa  173  1e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
152 aa  172  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 
190 aa  172  2e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 
178 aa  172  3e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 
351 aa  172  3e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.95 
 
 
175 aa  171  4e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  46.45 
 
 
243 aa  172  4e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 
238 aa  171  4e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 
180 aa  171  4e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 
169 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
239 aa  171  6e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
201 aa  171  8e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 
204 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 
183 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
173 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
183 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.53 
 
 
197 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 
177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 
173 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 
183 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
198 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 
225 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 
154 aa  167  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  8.64988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 
174 aa  167  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 
173 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 
178 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 
173 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
171 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.44125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 
221 aa  167  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
204 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 
159 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
174 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
164 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.44552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 
156 aa  165  3e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 
195 aa  165  3e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.25648e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  48.47 
 
 
163 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  53.47 
 
 
146 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88109e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>