15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0063 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0063  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  43.66 
 
 
191 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  31.25 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13871  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.947237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  30.08 
 
 
167 aa  55.1  3e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 
568 aa  47  9e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  26.4 
 
 
560 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  30.77 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  21.48 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  24.44 
 
 
169 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  26.89 
 
 
545 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30.77 
 
 
565 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>