118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0057 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  100 
 
 
410 aa  840  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  59.17 
 
 
402 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  55.94 
 
 
406 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  56.06 
 
 
400 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  52.97 
 
 
408 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  54.55 
 
 
407 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  52.68 
 
 
408 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  52.21 
 
 
409 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  56.02 
 
 
407 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  51.6 
 
 
407 aa  401  1e-110  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  50.39 
 
 
411 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  46.73 
 
 
413 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  48.97 
 
 
411 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  53.49 
 
 
438 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  46.49 
 
 
413 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  49.02 
 
 
409 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  53.58 
 
 
373 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  49.87 
 
 
416 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  50.13 
 
 
413 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  50 
 
 
412 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  48.54 
 
 
409 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  47.95 
 
 
411 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  48.35 
 
 
415 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  47.56 
 
 
433 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  47.56 
 
 
409 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  47.81 
 
 
420 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  47.56 
 
 
433 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  49.23 
 
 
431 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  47.42 
 
 
413 aa  362  5e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  49.1 
 
 
420 aa  362  5e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  45.39 
 
 
411 aa  338  1e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  46.02 
 
 
407 aa  321  1e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  46.02 
 
 
407 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  44.99 
 
 
407 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  45.5 
 
 
407 aa  313  3e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  42.49 
 
 
444 aa  303  4e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  43.26 
 
 
427 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  43.67 
 
 
415 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  40.56 
 
 
409 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  40.56 
 
 
410 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.01 
 
 
410 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  37.76 
 
 
407 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41.77 
 
 
410 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  36.83 
 
 
406 aa  243  4e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  35.84 
 
 
408 aa  235  1e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  35.32 
 
 
408 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  33.51 
 
 
400 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  31.53 
 
 
418 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  32.51 
 
 
405 aa  221  2e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.99 
 
 
400 aa  220  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  32.85 
 
 
419 aa  212  8e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.32 
 
 
421 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  30.77 
 
 
436 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  30.05 
 
 
416 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.9 
 
 
413 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.94 
 
 
409 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  27.32 
 
 
409 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  31.56 
 
 
400 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  27.23 
 
 
412 aa  131  2e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.98 
 
 
412 aa  130  4e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  27.46 
 
 
376 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  32.16 
 
 
359 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  25.39 
 
 
817 aa  89.7  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.75 
 
 
391 aa  83.6  6e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  32.88 
 
 
178 aa  82.4  1e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.86 
 
 
425 aa  75.5  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
383 aa  74.3  4e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.63 
 
 
414 aa  73.2  8e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  23.06 
 
 
390 aa  68.9  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.68 
 
 
406 aa  68.6  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  22.11 
 
 
396 aa  67.8  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
406 aa  67  5e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  22.75 
 
 
396 aa  65.9  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
361 aa  65.1  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  21.85 
 
 
402 aa  64.3  4e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.22 
 
 
305 aa  62  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  22.59 
 
 
406 aa  60.5  5e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  20.82 
 
 
421 aa  60.1  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  22.02 
 
 
414 aa  55.8  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  23.95 
 
 
303 aa  56.2  1e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.56 
 
 
303 aa  53.9  5e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
303 aa  53.9  5e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.42 
 
 
310 aa  52.8  1e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.5 
 
 
382 aa  52.8  1e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.66 
 
 
352 aa  52  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.96 
 
 
392 aa  50.4  5e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  24.54 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  23.56 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  22.64 
 
 
240 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  26.83 
 
 
226 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.27 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  22.69 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  25 
 
 
575 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
513 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  23.65 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.71 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>