30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0054 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  527  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  7.0397e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  54.18 
 
 
259 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  53.78 
 
 
256 aa  286  3e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  53.04 
 
 
244 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  52.97 
 
 
260 aa  276  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  55 
 
 
229 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  50 
 
 
259 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  49.8 
 
 
242 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  43.61 
 
 
270 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  43.37 
 
 
250 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  38.06 
 
 
252 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  38.06 
 
 
252 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  36.44 
 
 
250 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  36.64 
 
 
229 aa  174  1e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  38.11 
 
 
254 aa  172  3e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  35.96 
 
 
221 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  34.91 
 
 
229 aa  166  3e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  34.91 
 
 
229 aa  166  3e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  35.53 
 
 
221 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  35.06 
 
 
210 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  35.06 
 
 
210 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  35.06 
 
 
210 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  38.16 
 
 
191 aa  116  4e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  34.63 
 
 
210 aa  115  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  38.02 
 
 
170 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  38.02 
 
 
170 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  36.98 
 
 
170 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  35.98 
 
 
166 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  35.98 
 
 
166 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  30.5 
 
 
245 aa  79  8e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>