224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0053 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0053  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  785  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  5.65511e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0631  glycosyltransferase protein  23.15 
 
 
446 aa  71.2  3e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0753  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
400 aa  71.2  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
329 aa  67.4  4e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
329 aa  67.4  4e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
623 aa  62.8  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
235 aa  61.6  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
324 aa  60.8  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
305 aa  60.8  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
350 aa  60.5  5e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  58.9  1e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
370 aa  58.9  1e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
318 aa  58.2  2e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
321 aa  58.2  2e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0738  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
319 aa  58.2  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0554497  hitchhiker  0.00271528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.83 
 
 
340 aa  57.8  3e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
342 aa  58.2  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
268 aa  57.4  4e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
411 aa  57.4  4e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
316 aa  56.2  9e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
322 aa  55.8  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
318 aa  55.5  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
455 aa  55.5  1e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
276 aa  55.5  1e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
302 aa  55.8  1e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  33.03 
 
 
389 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 
347 aa  55.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2216  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
378 aa  55.1  2e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
284 aa  55.1  2e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3064  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
438 aa  55.1  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
704 aa  55.1  2e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
320 aa  55.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.62066e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
338 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 
347 aa  55.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  28.43 
 
 
329 aa  54.7  3e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
297 aa  54.3  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
304 aa  53.9  4e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  35.48 
 
 
295 aa  53.9  5e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
333 aa  53.5  7e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
581 aa  53.1  7e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.74352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
324 aa  53.5  7e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
347 aa  53.1  9e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.17 
 
 
306 aa  53.1  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.45 
 
 
341 aa  52.8  1e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  30.51 
 
 
309 aa  52.4  1e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  30.51 
 
 
309 aa  52.4  1e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
336 aa  52.8  1e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 
307 aa  52.8  1e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  30.51 
 
 
309 aa  52.8  1e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
286 aa  51.6  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1252 aa  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
343 aa  51.6  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
342 aa  52  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1252 aa  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
379 aa  52  2e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
310 aa  52.4  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
344 aa  51.2  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.7 
 
 
310 aa  51.2  3e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
345 aa  51.2  3e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.2136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
314 aa  51.2  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
353 aa  51.2  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
299 aa  50.8  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
309 aa  50.8  4e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
347 aa  50.8  4e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
255 aa  50.1  6e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
289 aa  50.1  6e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
275 aa  50.1  6e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
317 aa  50.1  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
341 aa  50.1  7e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
362 aa  50.1  7e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
335 aa  50.1  7e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
412 aa  50.1  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.33 
 
 
275 aa  49.7  8e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
412 aa  49.7  9e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
295 aa  49.7  9e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  30.11 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
812 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  30.77 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
1193 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
727 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.47 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.66 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 
303 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1250 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>