34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0052 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  61.63 
 
 
172 aa  221  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  39.53 
 
 
173 aa  141  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  45.35 
 
 
974 aa  139  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 
201 aa  70.1  1e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1750  hypothetical protein  33.85 
 
 
204 aa  61.6  5e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
200 aa  55.1  4e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5334  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
178 aa  53.5  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
281 aa  52.8  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  27.45 
 
 
189 aa  52  4e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  27.22 
 
 
172 aa  51.6  6e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  26.15 
 
 
403 aa  50.1  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
364 aa  48.5  4e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  25.29 
 
 
197 aa  48.5  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
197 aa  48.5  5e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.13 
 
 
242 aa  47.8  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
274 aa  47.4  9e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
284 aa  47.4  9e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.34 
 
 
764 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  40 
 
 
305 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1031  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3947  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  49.12 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  31.25 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  28.83 
 
 
535 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  29.33 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
235 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
278 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  44.26 
 
 
643 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
1451 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
1454 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  27.56 
 
 
216 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>