180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0051 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
633 aa  1305  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.89 
 
 
589 aa  284  4e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
589 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.53 
 
 
585 aa  276  1e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.35 
 
 
1106 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
754 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
754 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
1714 aa  254  5e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
633 aa  253  8e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
708 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
619 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
598 aa  246  1e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  39.77 
 
 
1106 aa  245  2e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
968 aa  245  2e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
833 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  36.88 
 
 
937 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.84 
 
 
708 aa  241  3e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
626 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.88 
 
 
715 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
627 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
828 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
833 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 
828 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.21 
 
 
529 aa  235  1e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
732 aa  235  2e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 
828 aa  235  2e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.88 
 
 
596 aa  234  4e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
595 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.53 
 
 
667 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 
789 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
789 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
718 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
713 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 
740 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  33.41 
 
 
1144 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.52 
 
 
1221 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  33.71 
 
 
699 aa  215  2e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
717 aa  215  2e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
734 aa  215  2e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.47 
 
 
1415 aa  214  4e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.51 
 
 
726 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
790 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  27.35 
 
 
797 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
717 aa  210  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
647 aa  210  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.93 
 
 
552 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.34 
 
 
742 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.74 
 
 
739 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
824 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
693 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
779 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
727 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
1143 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.29 
 
 
780 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
780 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 
790 aa  202  1e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.75 
 
 
739 aa  202  1e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
776 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
821 aa  200  8e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
821 aa  199  1e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
776 aa  199  1e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
776 aa  199  1e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.14 
 
 
739 aa  199  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
776 aa  199  1e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
776 aa  199  1e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
974 aa  198  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  34.82 
 
 
1116 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
1085 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
724 aa  195  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.9 
 
 
553 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.16 
 
 
921 aa  190  6e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.5 
 
 
633 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
781 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
723 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
822 aa  186  2e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
616 aa  185  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  32.78 
 
 
637 aa  184  4e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
909 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
632 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  26.65 
 
 
632 aa  176  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
740 aa  175  2e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
750 aa  175  3e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
796 aa  174  3e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
4489 aa  174  4e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
700 aa  174  6e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
647 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  32.43 
 
 
588 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  31.86 
 
 
657 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  31.67 
 
 
657 aa  170  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  30.25 
 
 
630 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
3560 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.74 
 
 
816 aa  168  3e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  31.17 
 
 
566 aa  167  6e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1094 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
618 aa  165  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  30.27 
 
 
459 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
733 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
732 aa  163  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
569 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
574 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>