More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0046 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
447 aa  898  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  39.91 
 
 
439 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  39.91 
 
 
444 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  38.22 
 
 
440 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  37.03 
 
 
441 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  36.81 
 
 
441 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
399 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.74 
 
 
414 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.3 
 
 
395 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  24.38 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
400 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.83 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  26.37 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.42 
 
 
400 aa  85.1  2e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 
779 aa  77.4  5e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  21.04 
 
 
779 aa  77  7e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  28.17 
 
 
398 aa  74.7  3e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  27.38 
 
 
441 aa  72.8  1e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
211 aa  71.2  4e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
275 aa  70.1  8e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  29.26 
 
 
441 aa  69.7  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  25.75 
 
 
434 aa  69.3  1e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
270 aa  69.7  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
268 aa  67  6e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.53 
 
 
865 aa  67  7e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.12 
 
 
580 aa  65.9  1e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.11 
 
 
238 aa  65.9  1e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
265 aa  64.7  3e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
285 aa  63.9  6e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
285 aa  63.9  6e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.38 
 
 
780 aa  62.8  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
236 aa  62.8  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.44 
 
 
402 aa  63.2  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  7.41696e-11 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  62  2e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36 
 
 
270 aa  62.4  2e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  25.39 
 
 
704 aa  61.6  3e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
283 aa  61.6  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.25 
 
 
237 aa  61.2  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
237 aa  60.8  4e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28 
 
 
360 aa  61.2  4e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
237 aa  60.8  4e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.92 
 
 
287 aa  61.2  4e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  24.02 
 
 
407 aa  60.8  5e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.98 
 
 
238 aa  60.5  6e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  31.01 
 
 
631 aa  60.1  7e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
285 aa  60.5  7e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  32.69 
 
 
351 aa  59.3  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 
359 aa  59.3  1e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
270 aa  59.7  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  34.75 
 
 
268 aa  59.3  1e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
272 aa  59.3  1e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
238 aa  58.9  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  6.08227e-06  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
353 aa  58.9  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
301 aa  58.9  2e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.58424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
269 aa  58.5  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.66 
 
 
296 aa  58.9  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.13 
 
 
1676 aa  58.2  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
272 aa  58.2  3e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  27.01 
 
 
359 aa  58.2  3e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36938e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  21.45 
 
 
402 aa  58.2  3e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
278 aa  58.2  3e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
226 aa  57.8  4e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
246 aa  57.8  4e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
348 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
194 aa  57.4  4e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.57 
 
 
653 aa  57.8  4e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
235 aa  57.4  5e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  3.18811e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
247 aa  57.4  5e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  31.73 
 
 
275 aa  57  7e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
276 aa  57  7e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.2 
 
 
253 aa  56.6  8e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.39 
 
 
252 aa  56.6  9e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
271 aa  56.2  1e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  24.86 
 
 
360 aa  55.8  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.46 
 
 
229 aa  56.2  1e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  1.65496e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.41 
 
 
201 aa  56.2  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.20373e-07  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
267 aa  56.2  1e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  26.73 
 
 
249 aa  56.2  1e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  29.13 
 
 
270 aa  56.2  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  2.11273e-07 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  31.31 
 
 
291 aa  55.5  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
238 aa  55.5  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
351 aa  55.5  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  33.01 
 
 
348 aa  55.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  23.79 
 
 
370 aa  55.1  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  34.95 
 
 
275 aa  55.5  2e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
351 aa  55.5  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
366 aa  55.5  2e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
309 aa  55.5  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  55.1  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  1.19347e-05 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.67 
 
 
276 aa  55.5  2e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
253 aa  55.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32.14 
 
 
240 aa  55.8  2e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  32.11 
 
 
201 aa  55.8  2e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  31.68 
 
 
357 aa  54.7  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 
293 aa  54.7  3e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
273 aa  54.7  3e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
351 aa  54.7  3e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
283 aa  54.7  3e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>