More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0041 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  100 
 
 
434 aa  838  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  46.12 
 
 
444 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  46.12 
 
 
444 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  47.6 
 
 
445 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  49.89 
 
 
445 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  49.5 
 
 
447 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  41.2 
 
 
447 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  36.24 
 
 
446 aa  254  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  30.89 
 
 
422 aa  193  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  31.25 
 
 
419 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  30.8 
 
 
423 aa  179  6e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  32.96 
 
 
447 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  29.61 
 
 
424 aa  175  2e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  33.18 
 
 
431 aa  172  7e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  32.03 
 
 
421 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  30.38 
 
 
424 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  32.8 
 
 
441 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  32.8 
 
 
444 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  32.8 
 
 
444 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  32.56 
 
 
441 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  29.81 
 
 
427 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  32.56 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  32.8 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  30.18 
 
 
427 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  32.8 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  32.34 
 
 
444 aa  167  3e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  32.33 
 
 
441 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  32.34 
 
 
441 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  32.35 
 
 
437 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  32.35 
 
 
437 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  31.24 
 
 
441 aa  164  2e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.52 
 
 
429 aa  165  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  32.55 
 
 
427 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  30.89 
 
 
431 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  31.24 
 
 
441 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  32.33 
 
 
441 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  31.77 
 
 
437 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  30.74 
 
 
451 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  32.49 
 
 
440 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.92 
 
 
427 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.56 
 
 
425 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  31.7 
 
 
441 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.56 
 
 
423 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.99539e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  31.7 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.51767e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  31.24 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  31.7 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  31.7 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  31.7 
 
 
441 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  32.04 
 
 
451 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  31.24 
 
 
441 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  29.89 
 
 
428 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  31.24 
 
 
441 aa  154  3e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.48 
 
 
425 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  30.62 
 
 
429 aa  154  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  29.86 
 
 
440 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  30.88 
 
 
428 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.95 
 
 
429 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.25 
 
 
440 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  31.19 
 
 
417 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  31.36 
 
 
426 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  34.48 
 
 
422 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  28.92 
 
 
428 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  31.39 
 
 
967 aa  139  8e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  30.89 
 
 
431 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.31 
 
 
577 aa  135  1e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  28.54 
 
 
415 aa  132  1e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  3.20263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  27.3 
 
 
424 aa  131  2e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  26.32 
 
 
422 aa  126  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  1.62894e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  29.8 
 
 
405 aa  119  1e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.4 
 
 
419 aa  118  2e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  25.12 
 
 
429 aa  118  2e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.98 
 
 
408 aa  118  2e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.58 
 
 
405 aa  114  4e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  5.61595e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  24.58 
 
 
422 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.41 
 
 
414 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.54 
 
 
404 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  25.55 
 
 
428 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.04 
 
 
408 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  28.01 
 
 
402 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.86642e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  25.52 
 
 
421 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  27.61 
 
 
424 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  23.76 
 
 
426 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  27.3 
 
 
384 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  25.13 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.16 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.19 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.25 
 
 
401 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.5 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.09 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  21.72 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  25.74 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  22.39 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  29.13 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  9.00832e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  24.65 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  28.79 
 
 
429 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.42 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  22.56 
 
 
430 aa  85.1  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  22.56 
 
 
430 aa  85.1  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  28.28 
 
 
429 aa  84.7  3e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.27 
 
 
396 aa  83.2  7e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>