204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0040 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  52.1 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  43.7 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  44.17 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  43.33 
 
 
120 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1027  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
123 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.657456  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  34.62 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  32.2 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  31.09 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0928  dihydroneopterin aldolase family protein  34.45 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
470 aa  70.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  30.91 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.77 
 
 
337 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  30.89 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.65 
 
 
292 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.09 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  36.72 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  32.79 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  31.97 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  35.4 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  35.4 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  34.17 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  31.19 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  38.21 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  34.17 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  32.26 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  32.77 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0027  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06471  dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147381  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  24.58 
 
 
276 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  31.63 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  28 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.2 
 
 
310 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  25.83 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  21.15 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  31.97 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  28.85 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>