57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0038 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  100 
 
 
158 aa  320  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 
154 aa  132  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 
154 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  49.24 
 
 
147 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
151 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
144 aa  113  8e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 
141 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
147 aa  108  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  43.66 
 
 
143 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  43.28 
 
 
139 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
132 aa  94  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
136 aa  60.1  1e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
183 aa  57.4  8e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
565 aa  55.5  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
166 aa  54.3  7e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
525 aa  53.9  8e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.81945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
140 aa  52.4  3e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  51.79 
 
 
153 aa  51.2  5e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
291 aa  50.8  8e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
139 aa  49.7  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  29.51 
 
 
152 aa  48.5  3e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
221 aa  48.9  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  32.89 
 
 
143 aa  48.1  4e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  5.04849e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
221 aa  47.4  7e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  55 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  37.14 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  55.56 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  40.35 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
101 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  35.8 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  55 
 
 
134 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  39.06 
 
 
134 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.58 
 
 
314 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  32.61 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3150  phosphohydrolase  43.14 
 
 
108 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.696001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.24 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  7.39307e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  43.14 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  44.07 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  32.65 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1839  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.16 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3709  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.49 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24468  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  41.82 
 
 
255 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 
149 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>