97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0033 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  229  8e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  57.69 
 
 
104 aa  127  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  51.96 
 
 
104 aa  114  4e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  51.96 
 
 
105 aa  112  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  55.79 
 
 
108 aa  112  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  55.79 
 
 
108 aa  112  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  52.13 
 
 
129 aa  110  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  53.19 
 
 
109 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  51.52 
 
 
104 aa  108  4e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  48.42 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  46.32 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  46.74 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  48.39 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  43.56 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 
112 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 
112 aa  81.3  4e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 
116 aa  80.9  6e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 
113 aa  79.7  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 
113 aa  79.7  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  37.11 
 
 
270 aa  72.4  2e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  41.05 
 
 
100 aa  72.4  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  37.89 
 
 
102 aa  72  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  41.11 
 
 
99 aa  70.9  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  38.38 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  45.59 
 
 
86 aa  68.6  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  34.69 
 
 
99 aa  66.2  1e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 
96 aa  61.6  4e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  34.41 
 
 
108 aa  61.6  4e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 
111 aa  61.6  4e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 
101 aa  57.8  5e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  52.63 
 
 
68 aa  56.2  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
98 aa  56.2  1e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 
131 aa  54.7  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 
96 aa  54.3  6e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.64 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 
102 aa  51.6  3e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 
96 aa  52  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  41.18 
 
 
121 aa  51.6  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 
102 aa  51.6  3e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 
96 aa  50.4  7e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.97 
 
 
98 aa  50.4  9e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  28.71 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 
98 aa  48.9  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  38.57 
 
 
96 aa  48.5  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  37.35 
 
 
86 aa  48.1  4e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  34.85 
 
 
106 aa  48.1  4e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  26.97 
 
 
115 aa  47.4  6e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  25.27 
 
 
114 aa  47.4  7e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 
103 aa  47  8e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  40.68 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.09 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.94 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  30.77 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  39.68 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  31.71 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  28.3 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  28.41 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  30.88 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  30.88 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  29.55 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  8.00451e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.51 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  34.38 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.06 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30.99 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  31.33 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  32.88 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  29.55 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  7.02025e-09 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  31.46 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  2.5763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  35.82 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 
94 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>