More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0030 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  100 
 
 
210 aa  420  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  50.75 
 
 
209 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  51.02 
 
 
232 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  50.25 
 
 
219 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  50.25 
 
 
219 aa  189  3e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  48.76 
 
 
212 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  48.76 
 
 
212 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  51.58 
 
 
206 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  45.24 
 
 
210 aa  178  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  40.7 
 
 
221 aa  174  1e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 
221 aa  172  3e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  40.2 
 
 
232 aa  172  4e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  41.58 
 
 
216 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  43.43 
 
 
242 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  41.58 
 
 
216 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  46.84 
 
 
210 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  43.09 
 
 
221 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  48.5 
 
 
213 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  44.22 
 
 
212 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  47.5 
 
 
212 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  49.49 
 
 
213 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  49.25 
 
 
206 aa  164  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  47.5 
 
 
212 aa  164  1e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  47.52 
 
 
210 aa  162  2e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  46.11 
 
 
217 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  43.41 
 
 
204 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  49.72 
 
 
212 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  41.29 
 
 
206 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  39.38 
 
 
205 aa  152  3e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  44.88 
 
 
216 aa  148  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  48.92 
 
 
209 aa  147  1e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  45 
 
 
202 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  41.18 
 
 
202 aa  144  8e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  46.88 
 
 
213 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  41.71 
 
 
474 aa  140  1e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  47.18 
 
 
202 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  42.46 
 
 
210 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  34.38 
 
 
210 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 
249 aa  125  4e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  42.44 
 
 
263 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  39.9 
 
 
242 aa  120  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  36.52 
 
 
190 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  39.9 
 
 
242 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.79 
 
 
242 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
242 aa  117  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  36.15 
 
 
242 aa  116  2e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  117  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  37.24 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  115  4e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  115  4e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  39.3 
 
 
228 aa  114  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
242 aa  113  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
242 aa  114  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  36.04 
 
 
217 aa  112  4e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  33.71 
 
 
201 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  33.71 
 
 
201 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 
243 aa  108  4e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.37689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 
244 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 
248 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  39.18 
 
 
212 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  34.01 
 
 
228 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
264 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  39.29 
 
 
226 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  38.5 
 
 
234 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  39.18 
 
 
212 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  32.02 
 
 
201 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.41 
 
 
646 aa  101  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
226 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.42 
 
 
243 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 
223 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  35.8 
 
 
242 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  37.39 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  2.24118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  39.23 
 
 
239 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  38.3 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  37.09 
 
 
232 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  37.82 
 
 
227 aa  97.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  38.07 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  36.02 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.15248e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.63248e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.55 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.68609e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  40 
 
 
244 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.75087e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  35.55 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  35.55 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.75745e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  35.55 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.76961e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
227 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  37.65 
 
 
212 aa  94  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
186 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.00914e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  40.23 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.33 
 
 
213 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  35.07 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.01687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  35.67 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  35.07 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.24623e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  35.07 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.43352e-08  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  38.37 
 
 
228 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  39.66 
 
 
227 aa  91.7  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>