More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0029 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  30.98 
 
 
270 aa  118  8e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  33.62 
 
 
254 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  31.17 
 
 
254 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  33.59 
 
 
474 aa  99  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.12 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04571  methylase  31.62 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.75 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  25.21 
 
 
251 aa  84.7  2e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.21 
 
 
251 aa  83.6  3e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.24 
 
 
272 aa  77.4  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  21.05 
 
 
256 aa  77.4  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  26.36 
 
 
285 aa  77.8  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.32 
 
 
250 aa  77.4  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.36 
 
 
309 aa  76.3  6e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  20.09 
 
 
256 aa  75.5  9e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  27.39 
 
 
279 aa  73.2  4e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.49 
 
 
252 aa  70.9  2e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.98 
 
 
307 aa  71.2  2e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.16 
 
 
268 aa  69.7  5e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  25.44 
 
 
250 aa  67.4  3e-10  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  26.2 
 
 
295 aa  65.9  7e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.45 
 
 
291 aa  63.9  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.61 
 
 
287 aa  64.3  2e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  25.57 
 
 
266 aa  64.7  2e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.08 
 
 
268 aa  63.9  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.63598e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.95 
 
 
253 aa  63.5  3e-09  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.39 
 
 
269 aa  63.5  3e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.79 
 
 
269 aa  63.9  3e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.39 
 
 
269 aa  63.9  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
247 aa  63.2  5e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  24.28 
 
 
269 aa  62.8  6e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  24.28 
 
 
269 aa  62.8  6e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  24.28 
 
 
269 aa  62.8  6e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  24.28 
 
 
269 aa  62.8  6e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  24.28 
 
 
269 aa  62.8  6e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 
254 aa  62.4  8e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 
254 aa  62.4  8e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 
254 aa  62.4  8e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.81 
 
 
283 aa  62.4  8e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5368  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 
263 aa  62.4  9e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  62  1e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17275e-11 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  24.44 
 
 
265 aa  62  1e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.94 
 
 
256 aa  60.8  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.11 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 
269 aa  60.8  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  34 
 
 
255 aa  60.8  2e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.52 
 
 
254 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37 
 
 
262 aa  61.2  2e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.81 
 
 
253 aa  60.5  3e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.65 
 
 
252 aa  60.5  3e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32 
 
 
237 aa  60.5  3e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 
260 aa  60.5  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 
269 aa  60.5  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
263 aa  60.5  3e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.05 
 
 
293 aa  60.1  4e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.13 
 
 
261 aa  59.3  6e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  23.24 
 
 
269 aa  59.3  6e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
252 aa  58.9  8e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31 
 
 
255 aa  58.5  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 
255 aa  58.5  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 
255 aa  58.5  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
254 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  25.24 
 
 
255 aa  58.5  1e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  25.42 
 
 
292 aa  58.2  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.94072e-06 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  24.28 
 
 
281 aa  57.4  2e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  25.42 
 
 
292 aa  58.2  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  24.28 
 
 
281 aa  57  3e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
268 aa  57.4  3e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33 
 
 
258 aa  56.6  4e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  25.12 
 
 
306 aa  56.6  4e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.62 
 
 
249 aa  56.6  5e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
315 aa  56.2  5e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 
259 aa  56.6  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
267 aa  56.2  6e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  24.69 
 
 
309 aa  56.2  6e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.31 
 
 
257 aa  55.8  7e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
262 aa  55.8  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  24.79 
 
 
325 aa  55.5  9e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.01 
 
 
258 aa  55.5  9e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.08 
 
 
257 aa  55.1  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.87 
 
 
266 aa  55.1  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  26.8 
 
 
249 aa  55.1  1e-06  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  23.77 
 
 
234 aa  54.7  1e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.06 
 
 
254 aa  55.5  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26 
 
 
260 aa  55.1  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 
230 aa  55.1  1e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.35 
 
 
269 aa  55.1  1e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.66 
 
 
294 aa  54.3  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
263 aa  54.3  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  3.22294e-07 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
252 aa  54.7  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.51 
 
 
268 aa  54.7  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.61 
 
 
285 aa  53.9  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.68 
 
 
207 aa  53.5  3e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
260 aa  53.1  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.53 
 
 
273 aa  53.1  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.9 
 
 
258 aa  53.1  5e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>