186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0025 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1136    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  39.77 
 
 
526 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.45 
 
 
607 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  33.13 
 
 
543 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.4 
 
 
565 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  33.53 
 
 
601 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  29.81 
 
 
567 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  32.09 
 
 
568 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  32.81 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  33.8 
 
 
533 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  31.64 
 
 
605 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  33.2 
 
 
547 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  31.33 
 
 
570 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  30 
 
 
571 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  30.68 
 
 
545 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  32 
 
 
551 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  30.69 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.09 
 
 
546 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  31.18 
 
 
572 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  31.37 
 
 
572 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  31.16 
 
 
569 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  29.13 
 
 
600 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  31.37 
 
 
600 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.84 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  31.58 
 
 
498 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  37.17 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.39 
 
 
361 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.93 
 
 
350 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 
350 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11531  putative dienelactone hydrolase  21.07 
 
 
515 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  26.67 
 
 
373 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  29.17 
 
 
343 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.2 
 
 
430 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11521  putative dienelactone hydrolase  20.29 
 
 
516 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.07 
 
 
347 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.64 
 
 
347 aa  87  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  27.92 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.47 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11451  putative dienelactone hydrolase  24.27 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.338208 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.56 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1058  putative dienelactone hydrolase  22.54 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.745735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  29.24 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  27.05 
 
 
372 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  27.46 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  27.75 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  30.6 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.12 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  33.85 
 
 
339 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0700  hypothetical protein  26.72 
 
 
530 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0432534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  29.32 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1961  hypothetical protein  26.91 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  25.36 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27.14 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  24.78 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25.45 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.31 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  30.34 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.74 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  26.92 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.87 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.68 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0706  fused serine peptidase/N-terminal uncharacterized domain protein  22.74 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.358194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  29.13 
 
 
313 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  29.97 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.96 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.29 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.29 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11381  putative dienelactone hydrolase  19.65 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  22.38 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.35 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.7 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15401  putative dienelactone hydrolase  21.85 
 
 
531 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  24.2 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  29.34 
 
 
330 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28.63 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.71 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  36.07 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  23.63 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  25.19 
 
 
320 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.27 
 
 
644 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.66 
 
 
382 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  26.78 
 
 
278 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  37.82 
 
 
319 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  36.13 
 
 
324 aa  63.9  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  38.89 
 
 
322 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.11 
 
 
645 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  36.21 
 
 
309 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  40 
 
 
308 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  29.29 
 
 
309 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  29.01 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.94 
 
 
645 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.67 
 
 
645 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.75 
 
 
665 aa  61.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  24.26 
 
 
476 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.82 
 
 
330 aa  60.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  25.81 
 
 
410 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08841  putative dienelactone hydrolase  28.42 
 
 
530 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.4 
 
 
645 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.86 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.89 
 
 
645 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>