81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0022 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0022  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  776  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.194683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1437  pentapeptide repeat protein  51.54 
 
 
411 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0807  pentapeptide repeat-containing protein  48.47 
 
 
430 aa  326  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3366  pentapeptide repeat protein  47.96 
 
 
421 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2745  pentapeptide repeat protein  47.96 
 
 
421 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6645e-08 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4514  pentapeptide repeat protein  48.02 
 
 
416 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0578732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0189  pentapeptide repeat-containing protein  48.49 
 
 
448 aa  314  1e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1435  pentapeptide repeat protein  55.67 
 
 
400 aa  310  3e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0753  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 
450 aa  307  2e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.25 
 
 
734 aa  63.9  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.7 
 
 
381 aa  54.3  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  34.02 
 
 
483 aa  52  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 
174 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1884  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
106 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61383e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.44 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  25.17 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  29.51 
 
 
169 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 
294 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.72848e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 
285 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 
184 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
266 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.15 
 
 
727 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
172 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  33.67 
 
 
174 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.03 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  1.37449e-05  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.36 
 
 
710 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  27.69 
 
 
706 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
1831 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.05 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.61 
 
 
213 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.03 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  45.83 
 
 
182 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  46.3 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  35.94 
 
 
537 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.53 
 
 
525 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  30.12 
 
 
961 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
514 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 
260 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.19 
 
 
1033 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 
145 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 
145 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 
158 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 
151 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
240 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.41 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 
214 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
493 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
567 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
844 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.92 
 
 
521 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  2.37208e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 
351 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
489 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  26.15 
 
 
219 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  30.58 
 
 
361 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 
131 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 
247 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.58172e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  33.63 
 
 
866 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26.17 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 
315 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>