More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0019 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3868  sulfite reductase subunit beta  61.72 
 
 
660 aa  838  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0019  sulfite reductase subunit beta  100 
 
 
624 aa  1281  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.508034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5043  sulfite reductase subunit beta  61.78 
 
 
650 aa  852  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2931  sulfite reductase subunit beta  58.69 
 
 
646 aa  808  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1667  sulfite reductase subunit beta  59.62 
 
 
638 aa  823  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1640  sulfite reductase subunit beta  59.62 
 
 
638 aa  825  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5022  sulfite reductase, ferredoxin dependent  61.65 
 
 
637 aa  828  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.299313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3544  sulfite reductase subunit beta  62.54 
 
 
902 aa  805  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25282  sulfite reductase  48.11 
 
 
690 aa  612  1e-174  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24374  predicted protein  51.99 
 
 
633 aa  614  1e-174  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.152438  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08251  sulfite reductase subunit beta  52.83 
 
 
596 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16711  sulfite reductase subunit beta  52.79 
 
 
598 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0766  sulfite reductase subunit beta  53.37 
 
 
595 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.958456  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1227  sulfite reductase subunit beta  54.29 
 
 
580 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.447806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10051  sulfite reductase subunit beta  52.87 
 
 
598 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.155233  normal  0.609504 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08181  sulfite reductase subunit beta  52.65 
 
 
595 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08201  sulfite reductase subunit beta  52.65 
 
 
595 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1242  sulfite reductase subunit beta  53.38 
 
 
580 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07941  sulfite reductase subunit beta  50.09 
 
 
601 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0162  sulfite reductase subunit beta  49.39 
 
 
601 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75375  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3309  hypothetical protein  47.32 
 
 
562 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.586333  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0852  Sulfite reductase (NADPH)  46.45 
 
 
566 aa  505  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  40.84 
 
 
571 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2423  Sulfite reductase (NADPH)  42.76 
 
 
560 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.230448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2432  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.72 
 
 
581 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1804  sulfite reductase subunit beta  43.03 
 
 
602 aa  452  1e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5484  sulfite reductase subunit beta  44.27 
 
 
602 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2513  sulfite reductase subunit beta  42.78 
 
 
612 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2237  sulfite reductase subunit beta  42.78 
 
 
657 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.327288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2195  sulfite reductase subunit beta  42.71 
 
 
612 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  41.58 
 
 
573 aa  439  1e-122  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3063  sulfite reductase subunit beta  42.17 
 
 
565 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1783  sulfite reductase subunit beta  42.01 
 
 
616 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3737  sulfite reductase subunit beta  41.48 
 
 
565 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0856  sulfite reductase subunit beta  41.14 
 
 
565 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0893  sulfite reductase subunit beta  41.14 
 
 
565 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1306  sulfite reductase subunit beta  39.86 
 
 
579 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.482907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3415  sulfite reductase subunit beta  41.82 
 
 
565 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0945  sulfite reductase subunit beta  41.82 
 
 
565 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0954  sulfite reductase subunit beta  41.82 
 
 
565 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3079  sulfite reductase subunit beta  41.14 
 
 
565 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05500  sulfite reductase, putative  39.68 
 
 
1885 aa  429  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  43.03 
 
 
563 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60645e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  43.03 
 
 
563 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0920  sulfite reductase subunit beta  41.65 
 
 
565 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2799  sulfite reductase subunit beta  40.14 
 
 
557 aa  425  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2190  sulfite reductase subunit beta  40.6 
 
 
572 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2695  sulfite reductase subunit beta  42.53 
 
 
575 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0702337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0777  sulfite reductase subunit beta  40.17 
 
 
594 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0933  sulfite reductase subunit beta  40.96 
 
 
562 aa  422  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0654  sulfite reductase subunit beta  39.93 
 
 
565 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3806  sulfite reductase subunit beta  39.97 
 
 
587 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0666  sulfite reductase subunit beta  40.24 
 
 
565 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  5.28094e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3192  sulfite reductase subunit beta  40.6 
 
 
563 aa  407  1e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0838  sulfite reductase subunit beta  41.08 
 
 
568 aa  406  1e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0751  sulfite reductase subunit beta  41.08 
 
 
568 aa  406  1e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07600  SE, putative sulfite reductase beta subunit-hemoprotein,ferredoxin oxidoreductase (Eurofung)  39.33 
 
 
1528 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  0.178099 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67906  Sulfite reductase [NADPH] beta subunit (Extracellular matrix protein 17)  39.48 
 
 
934 aa  400  1e-110  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0700093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3435  sulfite reductase subunit beta  38.84 
 
 
562 aa  389  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2426  sulfite reductase subunit beta  39.44 
 
 
578 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4760  sulfite reductase subunit beta  37.83 
 
 
584 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02132  sulfite reductase subunit beta  39.76 
 
 
568 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130377  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0217  sulfite reductase subunit beta  37.85 
 
 
566 aa  376  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0683  sulfite reductase subunit beta  38.16 
 
 
576 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3077  sulfite reductase subunit beta  36.59 
 
 
570 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.900908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2838  sulfite reductase subunit beta  36.36 
 
 
571 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3259  sulfite reductase subunit beta  36.59 
 
 
570 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.301229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3158  sulfite reductase subunit beta  36.59 
 
 
570 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3142  sulfite reductase subunit beta  36.42 
 
 
570 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.719922  normal  0.480652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002351  sulfite reductase [NADPH] hemoprotein beta-component  37.3 
 
 
578 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0210403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03588  sulfite reductase subunit beta  36.82 
 
 
573 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0828  sulfite reductase subunit beta  36.46 
 
 
571 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0591  sulfite reductase subunit beta  37.81 
 
 
576 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0776891  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3101  sulfite reductase subunit beta  36.26 
 
 
570 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159478  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00004  sulfite reductase subunit beta  37.13 
 
 
578 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3226  sulfite reductase subunit beta  36.21 
 
 
570 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73638  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2796  sulfite reductase subunit beta  37.02 
 
 
577 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000451372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3306  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  38.14 
 
 
564 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0859  sulfite reductase subunit beta  36.72 
 
 
571 aa  363  5e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.753141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2903  sulfite reductase subunit beta  35.69 
 
 
570 aa  360  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2891  sulfite reductase subunit beta  35.52 
 
 
570 aa  359  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3310  sulfite reductase subunit beta  35.7 
 
 
576 aa  359  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02571  hypothetical protein  35.52 
 
 
570 aa  358  1e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3112  sulfite reductase subunit beta  35.52 
 
 
570 aa  358  1e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4017  sulfite reductase subunit beta  35.52 
 
 
570 aa  358  1e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.96721  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3441  sulfite reductase subunit beta  35.7 
 
 
576 aa  359  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02608  sulfite reductase, beta subunit, NAD(P)-binding, heme-binding  35.52 
 
 
570 aa  358  1e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3065  sulfite reductase subunit beta  35.52 
 
 
570 aa  358  1e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0925  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  35.52 
 
 
570 aa  358  2e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3526  sulfite reductase subunit beta  35.17 
 
 
577 aa  357  4e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.19432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0949  sulfite reductase subunit beta  35.34 
 
 
570 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3364  sulfite reductase subunit beta  35.17 
 
 
577 aa  356  7e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0403  sulfite reductase subunit beta  36.19 
 
 
576 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0811  sulfite reductase subunit beta  36.03 
 
 
571 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4038  sulfite reductase subunit beta  35.95 
 
 
569 aa  351  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1294  Sulfite reductase (NADPH)  37.43 
 
 
546 aa  350  5e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0705  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.92 
 
 
630 aa  217  5e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0961  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29 
 
 
599 aa  184  4e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  3.32395e-05  normal  0.245939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  29.11 
 
 
521 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  29.96 
 
 
571 aa  157  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>