More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0010 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  57.42 
 
 
227 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  57.43 
 
 
209 aa  234  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  52.97 
 
 
209 aa  219  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  54.37 
 
 
212 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  54.95 
 
 
209 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  54.37 
 
 
212 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  39.51 
 
 
199 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.77 
 
 
215 aa  120  1e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.67 
 
 
457 aa  119  4e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.1 
 
 
211 aa  114  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  41.71 
 
 
355 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 
213 aa  110  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  46 
 
 
218 aa  110  1e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.83251e-13  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.56 
 
 
217 aa  108  4e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 
214 aa  108  7e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 
214 aa  108  7e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  37.43 
 
 
204 aa  108  7e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.22435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  37.08 
 
 
199 aa  108  8e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  39.34 
 
 
214 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 
217 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
205 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 
224 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.7 
 
 
206 aa  101  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  41.89 
 
 
211 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  39.49 
 
 
245 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 
202 aa  99  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 
213 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  35.8 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.57 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.63 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31934e-13 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  39.69 
 
 
256 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.87 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  31.63 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.12 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  35.62 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  32.91 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.12 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.3 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  30.61 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  30.61 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  31.12 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  32.91 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  30.61 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  30.61 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  30.61 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.57 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 
204 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  37.41 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.31966e-10  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.55 
 
 
201 aa  89  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  29.26 
 
 
195 aa  89  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  32.28 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  34.88 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42104e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  34.88 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  28.42 
 
 
212 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.73 
 
 
202 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.88 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  35.94 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.32 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.65 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.08 
 
 
521 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  37.42 
 
 
222 aa  84.3  1e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 
203 aa  84.3  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.77 
 
 
220 aa  84.3  1e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.62 
 
 
237 aa  84.3  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  34.57 
 
 
237 aa  84  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  29.05 
 
 
207 aa  84  1e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  35.29 
 
 
222 aa  83.2  2e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  28.65 
 
 
198 aa  83.6  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.6 
 
 
201 aa  84  2e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.7 
 
 
237 aa  84  2e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.43 
 
 
201 aa  82.8  3e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  35 
 
 
198 aa  82.4  4e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  34.12 
 
 
205 aa  82.4  4e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.84 
 
 
212 aa  82.4  5e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
218 aa  82  6e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  28 
 
 
201 aa  82  6e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  28 
 
 
201 aa  82  6e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
206 aa  81.6  7e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 
202 aa  81.6  8e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  23.83 
 
 
202 aa  81.3  9e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  31.71 
 
 
202 aa  81.3  9e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  33.33 
 
 
220 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.5 
 
 
201 aa  80.9  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.31988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 
205 aa  80.1  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  31.1 
 
 
202 aa  80.1  2e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>