More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0009 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  77.94 
 
 
401 aa  668  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  100 
 
 
400 aa  816  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  81.95 
 
 
401 aa  683  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  78.25 
 
 
400 aa  660  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  75.69 
 
 
399 aa  646  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  77.69 
 
 
399 aa  665  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  75.69 
 
 
399 aa  646  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  80.7 
 
 
400 aa  682  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  73.32 
 
 
403 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  73.25 
 
 
403 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  69.5 
 
 
401 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  66 
 
 
400 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  65 
 
 
400 aa  561  1e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  66.75 
 
 
400 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  62.91 
 
 
404 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  61.65 
 
 
404 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  62.16 
 
 
404 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  61.65 
 
 
404 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  59.64 
 
 
409 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
401 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  6.8553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 
401 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
401 aa  471  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 
401 aa  470  1e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  56.71 
 
 
401 aa  469  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  468  1e-130  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.28146e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  467  1e-130  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  467  1e-130  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  466  1e-130  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.72257e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  467  1e-130  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  58.46 
 
 
402 aa  465  1e-130  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 
401 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  58.38 
 
 
406 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  53.87 
 
 
413 aa  451  1e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
420 aa  454  1e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  54.2 
 
 
406 aa  451  1e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  1.03773e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  54.2 
 
 
406 aa  451  1e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.84052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
406 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  1.73868e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  54.27 
 
 
410 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  4.88823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  55.24 
 
 
399 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
399 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 
400 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  55.58 
 
 
400 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  54.31 
 
 
402 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 
464 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
396 aa  425  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  53.33 
 
 
401 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 
399 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  53.33 
 
 
403 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  52.96 
 
 
401 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  53.08 
 
 
400 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.88575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  52.82 
 
 
402 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 
399 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  53.33 
 
 
401 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  49.12 
 
 
404 aa  416  1e-115  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  51.66 
 
 
399 aa  415  1e-115  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  52.94 
 
 
397 aa  416  1e-115  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 
410 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  52.67 
 
 
402 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  52.76 
 
 
399 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  52.54 
 
 
401 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  52.54 
 
 
401 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
402 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
407 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
402 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
401 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
402 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 
408 aa  408  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  48.87 
 
 
400 aa  405  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
400 aa  405  1e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  49.75 
 
 
1496 aa  405  1e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
408 aa  406  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
401 aa  408  1e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  48.99 
 
 
399 aa  406  1e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
406 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
400 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  51.27 
 
 
398 aa  403  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
400 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  50 
 
 
400 aa  399  1e-110  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
400 aa  401  1e-110  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
410 aa  400  1e-110  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.84942e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11676  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
398 aa  399  1e-110  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.33354e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  47.21 
 
 
404 aa  399  1e-110  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
400 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
400 aa  400  1e-110  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  50 
 
 
414 aa  399  1e-110  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 
400 aa  401  1e-110  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
413 aa  398  1e-110  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
401 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10593e-07 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
399 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 
399 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
401 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 
412 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 
412 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
413 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 
405 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  49.48 
 
 
407 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
401 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
412 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  47.74 
 
 
403 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>