10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0006 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0006  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  270  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.83651  normal  0.21368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4741  hypothetical protein  60 
 
 
198 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  hitchhiker  0.00781362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0157  hypothetical protein  55.81 
 
 
192 aa  144  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0478  hypothetical protein  55.37 
 
 
181 aa  144  4e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4509  hypothetical protein  55.56 
 
 
146 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.323806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1154  hypothetical protein  48.78 
 
 
177 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00194031  hitchhiker  0.00507704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1342  hypothetical protein  47 
 
 
137 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.941271  hitchhiker  4.44571e-08 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1314  hypothetical protein  47 
 
 
137 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31020  predicted protein  35.56 
 
 
240 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0225189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0391  hypothetical protein  32.69 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.42902e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>