21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0005 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1047  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  58.77 
 
 
533 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  46.29 
 
 
589 aa  459  1e-128  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  46.08 
 
 
519 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.86 
 
 
530 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.86 
 
 
530 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.02 
 
 
596 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 
533 aa  289  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.86 
 
 
528 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.39 
 
 
530 aa  285  2e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  34.62 
 
 
551 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  34.77 
 
 
526 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.09 
 
 
501 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  33.87 
 
 
533 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 
527 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  31.35 
 
 
514 aa  226  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  32.18 
 
 
518 aa  219  9e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  32.73 
 
 
535 aa  213  5e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  32.58 
 
 
480 aa  213  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  32.21 
 
 
444 aa  207  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  23.98 
 
 
497 aa  117  4e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.19535e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>